87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02380 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  100 
 
 		 408 aa  802    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  50.3 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  52.76 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  40.94 
 
 		 190 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  40.94 
 
 		 190 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  38.81 
 
 		 178 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  36.72 
 
 		 228 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  36.72 
 
 		 228 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  39.53 
 
 		 175 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  39.23 
 
 		 214 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  34.78 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  41.74 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  36.69 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  37.04 
 
 		 214 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  37.04 
 
 		 214 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  35.51 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  40.38 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  37.78 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  39.39 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  33.85 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  38.52 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  36.92 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  39.5 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  40.91 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  30 
 
 		 271 aa  67  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  36.92 
 
 		 273 aa  67  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  30.71 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 233 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  36.51 
 
 		 293 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  34.65 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  35.16 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02960  micrococcal nuclease-like nuclease  28.92 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  28.8 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  32.09 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  31.01 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  27.56 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  28.1 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  36.96 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  28.24 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  32 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  30.71 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  35.34 
 
 		 153 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  38.6 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  31.51 
 
 		 153 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  28.68 
 
 		 251 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  28.66 
 
 		 256 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  36.15 
 
 		 153 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  27.4 
 
 		 197 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  39.8 
 
 		 171 aa  53.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  27.63 
 
 		 175 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.29 
 
 		 175 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  29.22 
 
 		 192 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  34.11 
 
 		 174 aa  52.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  32.28 
 
 		 267 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  29.81 
 
 		 166 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  33.03 
 
 		 169 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  34.81 
 
 		 218 aa  52.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  33.07 
 
 		 257 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  29.5 
 
 		 327 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  27.61 
 
 		 259 aa  50.8  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  35.92 
 
 		 183 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.12 
 
 		 175 aa  50.4  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  27.92 
 
 		 166 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  31.16 
 
 		 238 aa  50.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.87 
 
 		 164 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  30.71 
 
 		 266 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  32.81 
 
 		 247 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  54.35 
 
 		 1229 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  33.01 
 
 		 180 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  30 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  27.41 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  29.93 
 
 		 183 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  32.41 
 
 		 146 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  35.05 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  27.73 
 
 		 157 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  31.48 
 
 		 260 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  31.61 
 
 		 273 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  30.43 
 
 		 161 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  27.45 
 
 		 184 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  31.76 
 
 		 183 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  28.21 
 
 		 156 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  33.77 
 
 		 301 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  30.85 
 
 		 192 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  29.13 
 
 		 255 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  31.01 
 
 		 260 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  34.95 
 
 		 164 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>