More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02060 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_02060  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
311 aa  607  1e-172  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  60.13 
 
 
319 aa  339  3e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  61.99 
 
 
297 aa  332  4e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  60.96 
 
 
298 aa  325  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1233  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  59.06 
 
 
296 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447568  normal  0.0288811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  57.43 
 
 
309 aa  320  2e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5029  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  61.09 
 
 
293 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4941  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  61.09 
 
 
293 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4042  Glutamate--tRNA ligase  61.28 
 
 
285 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5322  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  61.09 
 
 
293 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5575  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  57.76 
 
 
310 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02670  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 
328 aa  257  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  54.55 
 
 
316 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  46.23 
 
 
323 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  46.86 
 
 
323 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  46.2 
 
 
323 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
318 aa  201  1e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  40.72 
 
 
311 aa  200  3e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  2.57577e-07  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.33 
 
 
295 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
317 aa  199  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  44.79 
 
 
313 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  42.81 
 
 
310 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  41.92 
 
 
310 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  43.91 
 
 
311 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.86478e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  42.95 
 
 
313 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  47.54 
 
 
337 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  47.58 
 
 
314 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.97 
 
 
311 aa  184  2e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.78146e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  38.9 
 
 
373 aa  183  4e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  44.98 
 
 
314 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3371  glutamate--tRNA ligase  42.63 
 
 
309 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
301 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.14 
 
 
303 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  3.45941e-06 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  40.58 
 
 
331 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  39.68 
 
 
330 aa  175  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.06 
 
 
334 aa  174  2e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
469 aa  172  8e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
472 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.02 
 
 
301 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  44.66 
 
 
283 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0922  glutamate--tRNA ligase  38.97 
 
 
300 aa  169  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.44 
 
 
299 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0851  Glutamate--tRNA ligase  41.18 
 
 
313 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.31695  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05721  glutamyl/glutaminyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
306 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.832335 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  41.4 
 
 
327 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
467 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
467 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 
479 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
465 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 
471 aa  167  3e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  39.76 
 
 
303 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.76322e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0605  glutamate--tRNA ligase  38.2 
 
 
316 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13731  glutamate--tRNA ligase  34.27 
 
 
312 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.259862  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3469  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.15 
 
 
394 aa  166  6e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.16518e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
466 aa  166  6e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
467 aa  166  6e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  5.0225e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3339  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.15 
 
 
321 aa  165  7e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.26145e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42650  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.95 
 
 
298 aa  165  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
329 aa  165  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1006  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.15 
 
 
384 aa  165  1e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.29322e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62510  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.39 
 
 
293 aa  165  1e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.632499  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
535 aa  164  2e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5657  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.69 
 
 
297 aa  163  4e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2234  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.18 
 
 
294 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0967  glutamyl-tRNA synthetase-related protein  42.68 
 
 
295 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5440  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.56 
 
 
293 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 
460 aa  162  7e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  5.71227e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3586  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.15 
 
 
294 aa  162  8e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
463 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  43.27 
 
 
293 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2091  glutamyl-tRNA synthetase-like  39.19 
 
 
293 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3639  Glutamate--tRNA ligase  47.04 
 
 
318 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00405  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.94 
 
 
299 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1703  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.31 
 
 
298 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2315  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.31 
 
 
298 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
464 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
490 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 
463 aa  160  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2338  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.92 
 
 
298 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
478 aa  159  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  35.56 
 
 
495 aa  159  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
472 aa  158  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  3.47292e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1325  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  41.33 
 
 
281 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2408  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.93 
 
 
314 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.97 
 
 
296 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
475 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 
464 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.96 
 
 
310 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  41.41 
 
 
292 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
475 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
464 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.02 
 
 
298 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 
504 aa  157  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
465 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
466 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  33.44 
 
 
473 aa  156  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2210  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.03 
 
 
315 aa  156  5e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895513  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
469 aa  156  5e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 
459 aa  156  5e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
470 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>