More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01820 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  100 
 
 
312 aa  620  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.47 
 
 
325 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.77 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.66 
 
 
334 aa  261  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.64 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.58 
 
 
304 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.52 
 
 
342 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
300 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.65 
 
 
318 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
300 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258358  normal  0.837912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
286 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000108841  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000377109 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5399  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.83 
 
 
300 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
289 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
307 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.28 
 
 
317 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
309 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
262 aa  168  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
299 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  39.34 
 
 
292 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
309 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  0.179396 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
320 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
312 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.44322 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2171  carbohydrate ABC transporter permease  35.09 
 
 
280 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0580768  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
309 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
297 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
307 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  34.91 
 
 
307 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  31.89 
 
 
318 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
296 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
312 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481723 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
313 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
317 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0740262  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
306 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
286 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 
310 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369054 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
324 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
328 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
311 aa  158  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
314 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453212  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
310 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  31.45 
 
 
325 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
314 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 
319 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
310 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
286 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 
319 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243677  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
300 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
299 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
290 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
295 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
296 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  36.65 
 
 
287 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
305 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0419  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.79 
 
 
296 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
315 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0566045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
306 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
295 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
311 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2083  carbohydrate ABC transporter permease  34.12 
 
 
286 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183943 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
326 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3673  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 
308 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246744  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3121  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.56 
 
 
317 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2547  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.18 
 
 
312 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.194318  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
328 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
308 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166359  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
311 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421015  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
287 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484603  normal  0.727796 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
310 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0803077  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
330 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0817185  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
289 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
337 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.906597  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
283 aa  152  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
304 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.707606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1529  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
318 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.149292 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15390  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.1 
 
 
314 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.642568  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
312 aa  151  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
317 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5641  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
427 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
313 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
317 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  hitchhiker  0.000478367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
315 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  34.02 
 
 
322 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
295 aa  151  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.982578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
304 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
318 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152531  normal  0.26367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
315 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
302 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
293 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
300 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
283 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000757089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>