More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01430 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  311  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 147 aa  84.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  40.14 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  35.2 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  29.53 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  49.21 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  40.95 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  38.46 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  41.41 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  48.33 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  29.57 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  30.84 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  37.11 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  30.89 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  28.68 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 303 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  48.08 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  27.72 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  41.49 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>