More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01420 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01420  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 431 aa  822    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  59.81 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  48.54 
 
 		 403 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  48.54 
 
 		 403 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  48.29 
 
 		 403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 		 402 aa  338  7e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4249  major facilitator superfamily MFS_1  55.42 
 
 		 416 aa  338  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  52.33 
 
 		 440 aa  336  5e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6077  major facilitator superfamily MFS_1  51.12 
 
 		 407 aa  335  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  49.05 
 
 		 404 aa  328  8e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  49.11 
 
 		 393 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6118  major facilitator superfamily protein MFS_1  51.12 
 
 		 402 aa  323  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.39659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2998  major facilitator superfamily MFS_1  47.21 
 
 		 412 aa  309  5e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156539  decreased coverage  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  51.91 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  52.28 
 
 		 408 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1563  major facilitator superfamily MFS_1  58.37 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2789  major facilitator superfamily protein MFS_1  47.18 
 
 		 568 aa  296  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  50.29 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 		 422 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0045  major facilitator transporter  52.05 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 565 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  50.61 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  44.3 
 
 		 428 aa  264  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 		 385 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  36.88 
 
 		 387 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  36.62 
 
 		 387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  37.84 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  37.57 
 
 		 387 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  37.57 
 
 		 387 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  37.3 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  37.3 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  37.3 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  37.3 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  39.88 
 
 		 368 aa  196  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2675  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 402 aa  154  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.429667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.31 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 521 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 511 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  30.43 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3897  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.5 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.49 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5832  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4471  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.35 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1996  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.566259  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.74 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.16 
 
 		 508 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.95 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.16 
 
 		 517 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4275  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.96 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.45 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.11 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  27.62 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.4 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.11 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2970  multidrug efflux system protein MdtE  26.75 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.87 
 
 		 541 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 545 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3040  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.6 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.071182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3908  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3555  multidrug efflux system protein MdtE  26.75 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.11 
 
 		 513 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1409  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4128  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.18 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422777  normal  0.15166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1203  multidrug efflux system protein MdtE  26.67 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.128409  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.65 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4240  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.18 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.21 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1329  multidrug efflux system protein MdtE  26.82 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.61 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.711123 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1212  multidrug efflux system protein MdtE  26.82 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.5282e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.64 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3100  multidrug efflux system protein MdtE  26.82 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.65 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.35 
 
 		 613 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.19 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 		 539 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.28 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.39 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>