68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01280 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
272 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  44.23 
 
 
255 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  39.66 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  40.25 
 
 
246 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  44.35 
 
 
252 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  35.43 
 
 
247 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  32.4 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  31.05 
 
 
240 aa  118  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  35.71 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  44.49 
 
 
278 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  35.68 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  31.6 
 
 
252 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  33.89 
 
 
252 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  30.71 
 
 
259 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  33.05 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  33.06 
 
 
245 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  31.58 
 
 
245 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  32.39 
 
 
255 aa  95.5  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  31.52 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  31.17 
 
 
245 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  31.52 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  31.52 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  31.52 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  30.86 
 
 
244 aa  92  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  31.05 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  30.92 
 
 
257 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  29.96 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  29.96 
 
 
245 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  30.04 
 
 
282 aa  89.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  29.96 
 
 
245 aa  89  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  30.04 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  29.61 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  30.62 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  26.92 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  30.38 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  32.77 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  30.74 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  30.09 
 
 
244 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  32.31 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  32.07 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  27.94 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  27.53 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  28.34 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  23.85 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  30.13 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  26.21 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  26.25 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  24.38 
 
 
272 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  30.83 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  25.85 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  25.85 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  25.85 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  22.54 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  27.24 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  23.61 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  28.15 
 
 
251 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  28.15 
 
 
253 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  23.73 
 
 
291 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  26.21 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  26.52 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  25.38 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  22.42 
 
 
344 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  23.92 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  26.44 
 
 
260 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  26.44 
 
 
260 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  44 
 
 
243 aa  42.7  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  27.27 
 
 
255 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>