190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01180 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_01180  dihydroxyacetone kinase  100 
 
 
332 aa  648    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2457  Glycerone kinase  64.76 
 
 
332 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.64 
 
 
333 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.04 
 
 
333 aa  316  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  52.57 
 
 
333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.04 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.94 
 
 
355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.45 
 
 
333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.64 
 
 
332 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.57 
 
 
333 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.57 
 
 
333 aa  298  9e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.82 
 
 
364 aa  292  4e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.96 
 
 
333 aa  291  7e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  51.95 
 
 
544 aa  292  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  49.85 
 
 
331 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2347  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  52.87 
 
 
333 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.94 
 
 
331 aa  290  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  49.7 
 
 
546 aa  289  6e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0040  dihydroxyacetone kinase family protein  48.94 
 
 
329 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  51.35 
 
 
544 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  51.35 
 
 
544 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.34 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.9 
 
 
330 aa  285  8e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.15 
 
 
332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.06 
 
 
329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.06 
 
 
329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  47.56 
 
 
544 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.2 
 
 
333 aa  282  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.27 
 
 
327 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2438  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.06 
 
 
330 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288269  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  53.78 
 
 
331 aa  277  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  47.27 
 
 
327 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  46.04 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.55 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.34 
 
 
332 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  45.12 
 
 
583 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  45.12 
 
 
583 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  42.99 
 
 
582 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.82 
 
 
331 aa  270  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.66 
 
 
356 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.66 
 
 
356 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  43.66 
 
 
356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.66 
 
 
356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  43.66 
 
 
356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  44.82 
 
 
583 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.66 
 
 
356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  43.9 
 
 
583 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.38 
 
 
356 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.38 
 
 
369 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.91 
 
 
354 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  50.15 
 
 
330 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.79 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.15 
 
 
332 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.21 
 
 
354 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.51 
 
 
356 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.59 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.24 
 
 
329 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.29 
 
 
332 aa  262  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  43.79 
 
 
352 aa  262  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  45.12 
 
 
583 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  44.82 
 
 
583 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  44.82 
 
 
583 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.34 
 
 
331 aa  260  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  44.82 
 
 
583 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  44.51 
 
 
583 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.85 
 
 
329 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  44.21 
 
 
583 aa  255  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  44.21 
 
 
583 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.36 
 
 
354 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.96 
 
 
354 aa  252  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.58 
 
 
331 aa  252  8.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.81 
 
 
333 aa  247  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1154  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50.45 
 
 
335 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.5 
 
 
332 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  45.54 
 
 
567 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40 
 
 
325 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.5 
 
 
331 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.63 
 
 
329 aa  236  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.85 
 
 
333 aa  236  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  43.98 
 
 
572 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  41.85 
 
 
334 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  46.01 
 
 
570 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  39.82 
 
 
333 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.76 
 
 
322 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.76 
 
 
322 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  44.35 
 
 
616 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  45.69 
 
 
616 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  45.69 
 
 
570 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  45.69 
 
 
570 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  43.37 
 
 
569 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  43.37 
 
 
569 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  40.62 
 
 
334 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  37.84 
 
 
335 aa  229  6e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  42.86 
 
 
566 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  44.24 
 
 
567 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  41.52 
 
 
331 aa  228  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  37.93 
 
 
577 aa  228  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.25 
 
 
332 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1105  Glycerone kinase  42.95 
 
 
572 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  42.58 
 
 
333 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>