More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01030 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 522 aa  1044    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  62.12 
 
 		 513 aa  658    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  67.66 
 
 		 526 aa  703    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  57.68 
 
 		 529 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  57.43 
 
 		 505 aa  551  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  55.38 
 
 		 507 aa  541  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  55.82 
 
 		 503 aa  545  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  50.6 
 
 		 504 aa  502  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  49.59 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  49.59 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  49.59 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  50 
 
 		 504 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  47.29 
 
 		 510 aa  488  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  49.8 
 
 		 504 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  50.3 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  49.29 
 
 		 503 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  48.93 
 
 		 526 aa  482  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  49.9 
 
 		 511 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  50.3 
 
 		 525 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  49.51 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  50.6 
 
 		 502 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  50.3 
 
 		 525 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  48.09 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  48.69 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  48.49 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  47.89 
 
 		 500 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  47.89 
 
 		 500 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  47.96 
 
 		 549 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  47.89 
 
 		 500 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  47.89 
 
 		 500 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 500 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 500 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  47.48 
 
 		 507 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  47.89 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  46.4 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 500 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  46.79 
 
 		 523 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0277  ABC transporter related  47.24 
 
 		 511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.277921  normal  0.268674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  46.2 
 
 		 500 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  46.2 
 
 		 499 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  47.36 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  45.6 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  45.54 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  47.33 
 
 		 515 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  47.19 
 
 		 496 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  47.39 
 
 		 496 aa  442  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.46 
 
 		 516 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  47.19 
 
 		 496 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  45.6 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.69 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  44.71 
 
 		 506 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  44.51 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  44.02 
 
 		 544 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  43.84 
 
 		 544 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 		 501 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  41.34 
 
 		 501 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  45.83 
 
 		 519 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  44.95 
 
 		 519 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.28 
 
 		 517 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 497 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.77 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  41.26 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  39.96 
 
 		 505 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  41.1 
 
 		 537 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  40.4 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  38.76 
 
 		 498 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  41.3 
 
 		 501 aa  379  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  42.44 
 
 		 516 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  42.6 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.94 
 
 		 510 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 517 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 		 517 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.04 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 		 517 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 		 517 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  40.98 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  39.88 
 
 		 503 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.51 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.95 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.09 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.94 
 
 		 527 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.92 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  41.19 
 
 		 504 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  40.94 
 
 		 524 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 		 515 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.72 
 
 		 515 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  40.89 
 
 		 524 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  40.94 
 
 		 524 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  42.8 
 
 		 585 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 		 515 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 		 510 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  41.21 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  40.94 
 
 		 524 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.18 
 
 		 524 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.79 
 
 		 495 aa  365  1e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  40.16 
 
 		 507 aa  365  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  40.77 
 
 		 514 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  41.95 
 
 		 517 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>