35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00950 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_00950  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  826    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5140  hypothetical protein  39.41 
 
 
443 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534861  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0139  acyltransferase 3  39.35 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.304359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3213  acyltransferase 3  38.62 
 
 
471 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147244  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2991  acyltransferase 3  39.33 
 
 
471 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2095  acyltransferase 3  37.18 
 
 
454 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1827  acyltransferase 3  37.82 
 
 
442 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00111399  normal  0.153762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6199  hypothetical protein  33.67 
 
 
435 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35530  hypothetical protein  36.01 
 
 
377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0822  acyltransferase 3  34.05 
 
 
501 aa  161  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2249  hypothetical protein  36.99 
 
 
400 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  0.0169259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4548  acyltransferase 3  32.41 
 
 
462 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4601  hypothetical protein  33.25 
 
 
442 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3017  hypothetical protein  34.64 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3242  hypothetical protein  35.7 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00180744  normal  0.383189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3490  hypothetical protein  32.87 
 
 
438 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457776 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2412  hypothetical protein  31.14 
 
 
474 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0509  hypothetical protein  33.06 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09250  hypothetical protein  33.88 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4565  hypothetical protein  33.23 
 
 
432 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.37912 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2523  hypothetical protein  33.67 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0277  hypothetical protein  29.44 
 
 
448 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5060  hypothetical protein  29.13 
 
 
418 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1358  hypothetical protein  32.55 
 
 
412 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3453  hypothetical protein  29.55 
 
 
442 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1392  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6232  hypothetical protein  28.37 
 
 
723 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352941  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3210  hypothetical protein  31.21 
 
 
432 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14780  hypothetical protein  32.79 
 
 
445 aa  90.1  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2933  hypothetical protein  29.03 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746558  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2947  hypothetical protein  28.22 
 
 
425 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.706126  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2903  hypothetical protein  28.22 
 
 
425 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142442  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3448  acyltransferase 3  29.52 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3827  acyltransferase 3  27.31 
 
 
401 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2916  acyltransferase 3  26.55 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28890  hypothetical protein  24.51 
 
 
703 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.798667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>