35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00890 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_00890  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  100 
 
 
194 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1820  Polyketide cyclase/dehydrase  51.66 
 
 
153 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1562  hypothetical protein  51.23 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1592  hypothetical protein  50 
 
 
164 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1616  hypothetical protein  50 
 
 
164 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0758  hypothetical protein  49.67 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0146  hypothetical protein  47.1 
 
 
167 aa  131  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2697  hypothetical protein  42.68 
 
 
168 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29980  hypothetical protein  36.48 
 
 
161 aa  96.3  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633203  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01460  hypothetical protein  33.55 
 
 
160 aa  80.9  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3232  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.200936 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23960  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  32 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151523  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2272  hypothetical protein  30.49 
 
 
158 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509187  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2215  hypothetical protein  30.49 
 
 
158 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.581092  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2226  hypothetical protein  30.49 
 
 
158 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22480  hypothetical protein  36.64 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0283  hypothetical protein  37.6 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2607  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.18 
 
 
161 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3939  Polyketide cyclase/dehydrase  34.68 
 
 
149 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1770  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.42 
 
 
148 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2498  hypothetical protein  29.94 
 
 
159 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2557  hypothetical protein  28.97 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3906  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0838  hypothetical protein  32.12 
 
 
162 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103566  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2275  Polyketide cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
151 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3512  hypothetical protein  24.75 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0670  hypothetical protein  35.19 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0325  hypothetical protein  35.9 
 
 
147 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246806  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5222  Polyketide cyclase/dehydrase  31.79 
 
 
147 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178812  normal  0.128048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06190  hypothetical protein  34.53 
 
 
157 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10089  hypothetical protein  35.77 
 
 
224 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29102  normal  0.214951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5552  hypothetical protein  33.04 
 
 
160 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5260  hypothetical protein  33.04 
 
 
160 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5171  hypothetical protein  33.04 
 
 
160 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21390  hypothetical protein  30.86 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>