258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00880 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_00880  Kef-type K+ transport system, membrane component  100 
 
 
402 aa  758    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  37.88 
 
 
402 aa  223  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  34.05 
 
 
402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1900  sodium/hydrogen exchanger  39.46 
 
 
557 aa  177  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000133298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  37.06 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1763  sodium/hydrogen exchanger  39.25 
 
 
406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3791  sodium/hydrogen exchanger  38.98 
 
 
406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170031  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0897  sodium/hydrogen exchanger  35.62 
 
 
398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0565  sodium/hydrogen exchanger  34.45 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0334  sodium/hydrogen exchanger  36.44 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1839  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
416 aa  124  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  23.88 
 
 
484 aa  96.3  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.69 
 
 
484 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.38 
 
 
608 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  21.99 
 
 
611 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  22.66 
 
 
614 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  20.85 
 
 
609 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  21.43 
 
 
609 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  24.68 
 
 
715 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  20.6 
 
 
609 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  20.6 
 
 
609 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  26.58 
 
 
688 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  29.05 
 
 
679 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2361  potassium efflux system protein  29.15 
 
 
618 aa  67  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  20.95 
 
 
609 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  20.95 
 
 
609 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  20.95 
 
 
609 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  20.95 
 
 
609 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  20.95 
 
 
609 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  21.82 
 
 
614 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  21.82 
 
 
614 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.97 
 
 
572 aa  65.1  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  28.66 
 
 
741 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  20.35 
 
 
609 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  20.35 
 
 
609 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  27.79 
 
 
569 aa  63.9  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  24.32 
 
 
375 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  22.7 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  26.07 
 
 
698 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  24.64 
 
 
390 aa  63.2  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  23.99 
 
 
375 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  25.84 
 
 
698 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  24.52 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  23.72 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  24.09 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  23.72 
 
 
375 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  23.72 
 
 
375 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  24.31 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  23.72 
 
 
375 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  23.72 
 
 
375 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  24.31 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  26.2 
 
 
568 aa  62  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  22.94 
 
 
721 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.24 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  24.24 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  22.91 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  22.08 
 
 
609 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  24.52 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.18 
 
 
399 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  24.52 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  24.52 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.78 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.24 
 
 
387 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 
389 aa  60.1  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  22.11 
 
 
396 aa  59.7  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  23.64 
 
 
375 aa  59.7  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  30.48 
 
 
601 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  29.46 
 
 
806 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  30.48 
 
 
601 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1944  Sodium/hydrogen exchanger  22.41 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  30.48 
 
 
601 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  30.48 
 
 
601 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
709 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0178  Na+/H+ antiporter  25.35 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577111  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2288  radical SAM protein  25.5 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 
751 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  23.42 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  25.31 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  27.97 
 
 
652 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0159  Na+/H+ antiporter  25.14 
 
 
392 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  30.11 
 
 
601 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  22.69 
 
 
530 aa  57.4  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0872  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.01 
 
 
635 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37465  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1852  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.76 
 
 
391 aa  57  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.1 
 
 
620 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.1 
 
 
620 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.1 
 
 
620 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  24.53 
 
 
658 aa  56.6  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  24.41 
 
 
716 aa  56.6  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.1 
 
 
620 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  29 
 
 
601 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1676  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.51 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  24.68 
 
 
621 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  27.51 
 
 
660 aa  56.2  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.95 
 
 
620 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  29.69 
 
 
604 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.6 
 
 
620 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.87 
 
 
620 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2056  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.33 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>