More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00520 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00520  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 280 aa  551  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28670  triosephosphate isomerase  60 
 
 		 250 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.887125  normal  0.0357824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1549  triosephosphate isomerase  51.45 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  normal  0.289176 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2906  triosephosphate isomerase  46.93 
 
 		 256 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0869  triosephosphate isomerase  46.57 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0816  triosephosphate isomerase  46.57 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.992949  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5328  triosephosphate isomerase  45.79 
 
 		 256 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3113  triosephosphate isomerase  43.8 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0355095  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4651  triosephosphate isomerase  45.05 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743996  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2150  triosephosphate isomerase  44.73 
 
 		 255 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1358  triosephosphate isomerase  42.6 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0988  triosephosphate isomerase  41.58 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0752  triosephosphate isomerase  41.22 
 
 		 264 aa  201  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2155  triosephosphate isomerase  41.58 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.704147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  39.93 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  38.2 
 
 		 646 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  36.04 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  40.72 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  36.33 
 
 		 251 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  34.3 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  34.07 
 
 		 650 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  41.09 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  41.18 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  35.4 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  33.45 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  38.2 
 
 		 251 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  34.86 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  35.53 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  33.57 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  35.02 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  41.23 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  34.39 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  34.19 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  33.81 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  33.81 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  32.37 
 
 		 250 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  37.09 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  39.82 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  37.5 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  33.95 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  33.46 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  33.7 
 
 		 252 aa  142  8e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  35.02 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  42.27 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  33.92 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  35.53 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  35.09 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  35.09 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  33.69 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  32.73 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  35.25 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  33.68 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  34.29 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  32.63 
 
 		 251 aa  138  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  34.05 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  39.47 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  37.9 
 
 		 243 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  33.81 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  37.32 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  37.61 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  33.58 
 
 		 655 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  40.09 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  36.6 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  38.91 
 
 		 261 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  32.04 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7124  predicted protein  37.59 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000122567  normal  0.0110543 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  41.04 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  38.18 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  38.68 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  35.78 
 
 		 250 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  32.03 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  32.98 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  36.52 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  33.81 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  36.53 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  31.44 
 
 		 298 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  40.57 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  36.6 
 
 		 249 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  37.74 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  33.82 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  34.51 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  39.51 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  40.1 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  33.21 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  34.7 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  38.54 
 
 		 271 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  38.89 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  35.75 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  34.98 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  38.79 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  35.68 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  40.38 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  38.43 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  37.67 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  38.91 
 
 		 261 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  38.91 
 
 		 261 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0239  triosephosphate isomerase  37.44 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000101955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  38.91 
 
 		 261 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  38.22 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>