283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00130 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00130  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  314  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  68.53 
 
 		 174 aa  181  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01130  hypothetical protein  62.58 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.75 
 
 		 172 aa  172  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.433754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.03 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375974  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1027  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  66.43 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278653  normal  0.0205015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.24 
 
 		 165 aa  164  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2987  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.31 
 
 		 171 aa  160  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5579  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.79 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  26.71 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  31.53 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  31.54 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  36.13 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  29.23 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  34.82 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  37.6 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  21.15 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  32 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  34.13 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  33.06 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  33.06 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3691  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.95 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  31.71 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  36.11 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.7 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  35.71 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  31.93 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  32.33 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  33.06 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  33.91 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.85 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0122906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  28.23 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  29.84 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  35.71 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  30.36 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  32.76 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  31.58 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.74 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  32.03 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2912  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.89 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.92 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  31.58 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  32.79 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  34.31 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  30.51 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  29.71 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  30.22 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  30.65 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  30.08 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  31.48 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  24.41 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  32.14 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1755  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.7 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  29.84 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  30.4 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 573 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 573 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  30.4 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0371  ebsC protein, putative  31.25 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1069  ybaK/ebsC protein  31.25 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  30.84 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  36.05 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  31.25 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  35.83 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  28.23 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0671  putative ebsC protein  31.25 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2506  putative ebsC protein  31.25 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0913  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.25 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0917  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.25 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0912844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0120  putative ebsC protein  31.25 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.56 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  30.58 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  37.5 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  29.32 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3500  ybaK/ebsC protein  26.62 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00301765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  33.6 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  29.84 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3822  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.71 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.808721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1653  putative ybaK-like protein  37.21 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0686  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.53 
 
 		 188 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  25.4 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  30.08 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  28.57 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  34.88 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  36.19 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.61 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  28.12 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  32.28 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4290  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.59 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000309077  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  29.27 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  28.57 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 564 aa  51.2  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>