66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00040 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  100 
 
 		 266 aa  522  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  41.99 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  41.99 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  41.99 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  39.78 
 
 		 185 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  46.62 
 
 		 187 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  38.29 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  39.6 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  40.13 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  47.11 
 
 		 173 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  48.33 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  37.85 
 
 		 185 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.7 
 
 		 196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  39.13 
 
 		 188 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  40.1 
 
 		 188 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  45.67 
 
 		 180 aa  108  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  42.86 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  44.27 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  48.03 
 
 		 143 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  42.52 
 
 		 166 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  44.88 
 
 		 184 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  48.46 
 
 		 171 aa  102  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  42.19 
 
 		 188 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  40.91 
 
 		 177 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  40.83 
 
 		 134 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  41.18 
 
 		 164 aa  96.3  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  42.19 
 
 		 183 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  44.09 
 
 		 217 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  46.62 
 
 		 198 aa  95.1  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  39.2 
 
 		 172 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  45.08 
 
 		 201 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  38.02 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  39.25 
 
 		 156 aa  87.4  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  38 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  34.67 
 
 		 179 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  31.75 
 
 		 155 aa  81.3  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  42.98 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  34.78 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  37.5 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  30.23 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  33.33 
 
 		 117 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  33.82 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  33.71 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  29.52 
 
 		 188 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  34.29 
 
 		 162 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  31.43 
 
 		 161 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  29.63 
 
 		 173 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  31.43 
 
 		 162 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  32.97 
 
 		 169 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  26.37 
 
 		 96 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2665  hypothetical protein  32.95 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  28.44 
 
 		 180 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  25.84 
 
 		 160 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  32 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2421  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.464043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0717  hypothetical protein  34.15 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.695432 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2673  protein of unknown function DUF721  27.94 
 
 		 151 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.212988  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04281  hypothetical protein  25.41 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  27.82 
 
 		 186 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  27.54 
 
 		 101 aa  42.7  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1595  protein of unknown function DUF721  19.78 
 
 		 194 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.215209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1572  protein of unknown function DUF721  19.78 
 
 		 194 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  27.54 
 
 		 101 aa  42  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  26.74 
 
 		 170 aa  42  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04851  hypothetical protein  24.64 
 
 		 139 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>