232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5571 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5571  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  100 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.244703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3068  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  92.24 
 
 
232 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.65769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3308  l-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  92.24 
 
 
232 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3288  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  92.67 
 
 
232 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2482  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  90.95 
 
 
232 aa  435  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1074  L-serine ammonia-lyase  50.26 
 
 
220 aa  192  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000107918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2835  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.7 
 
 
220 aa  178  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0988  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.7 
 
 
220 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3971  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.7 
 
 
220 aa  175  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4248  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.26 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4272  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40.81 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4209  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40.99 
 
 
219 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3885  L-serine dehydratase subunit beta  40.99 
 
 
219 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3893  L-serine dehydratase, beta subunit  40.99 
 
 
219 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4162  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40.99 
 
 
219 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4047  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  40.99 
 
 
219 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4361  l-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  40.99 
 
 
219 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1965  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.01 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1075  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.1 
 
 
220 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102707  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0887  L-serine ammonia-lyase  45.57 
 
 
223 aa  151  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0556305  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1282  L-serine dehydratase beta subunit  37.84 
 
 
223 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.38968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2145  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  47.2 
 
 
222 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1252  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  45.45 
 
 
221 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.809325  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2095  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  45.22 
 
 
227 aa  132  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2555  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  46.54 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2607  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  46.54 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1420  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  35.16 
 
 
222 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0503  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  38.38 
 
 
549 aa  126  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.742023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1332  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.72 
 
 
221 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385667  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10070  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.79 
 
 
541 aa  123  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000332749  hitchhiker  0.0000000458611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1460  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.38 
 
 
222 aa  122  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2853  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.05 
 
 
221 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0221158 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16340  L-serine ammonia-lyase, beta subunit  41.45 
 
 
218 aa  121  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000548669  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16320  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.48 
 
 
552 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  hitchhiker  0.00195001 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1245  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.14 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0325404  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2064  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  33.63 
 
 
224 aa  115  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1947  L-serine ammonia-lyase  41.06 
 
 
218 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.376252  hitchhiker  0.000000222078 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1057  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.48 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0266  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  38.78 
 
 
224 aa  112  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1507  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  35 
 
 
220 aa  111  7.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000296361  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3836  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  49.09 
 
 
223 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0141316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0952  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  43.94 
 
 
536 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235834 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2642  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.05 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0199  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  45 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000476395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2959  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  34.09 
 
 
226 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0336  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  34.46 
 
 
216 aa  108  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.866527  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0097  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  32.65 
 
 
220 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000599373  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1475  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  35.05 
 
 
220 aa  101  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1760  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40 
 
 
229 aa  91.7  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.178826  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1548  serine dehydratase alpha chain  35.42 
 
 
519 aa  71.6  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000153411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3319  L-serine ammonia-lyase  34.15 
 
 
557 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0871  L-serine dehydratase 1  38.78 
 
 
448 aa  58.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6165  L-serine dehydratase  36.44 
 
 
485 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3144  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  33.75 
 
 
458 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  34.18 
 
 
458 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2711  L-serine dehydratase 1  33.75 
 
 
458 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.468733 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  43.68 
 
 
499 aa  52  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5758  L-serine dehydratase 1  41.67 
 
 
475 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2570  L-serine dehydratase 1  32.73 
 
 
458 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1806  L-serine dehydratase 1  33.11 
 
 
458 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0322  L-serine dehydratase 1  31.65 
 
 
458 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3490  L-serine dehydratase 1  34.19 
 
 
458 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71060  L-serine dehydratase  44 
 
 
458 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4911  L-serine dehydratase 1  38.89 
 
 
458 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2838  L-serine ammonia-lyase  33.77 
 
 
458 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947815  hitchhiker  0.0000107679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0297  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  39.53 
 
 
458 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3333  L-serine ammonia-lyase  32.9 
 
 
458 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0317  L-serine dehydratase 1  39.53 
 
 
458 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0288  L-serine ammonia-lyase  30.26 
 
 
455 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1902  L-serine dehydratase  30.26 
 
 
455 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.457679  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  32.69 
 
 
462 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  40 
 
 
456 aa  48.9  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0995  L-serine ammonia-lyase  32.35 
 
 
490 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3164  L-serine dehydratase 1  32.9 
 
 
458 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3321  L-serine ammonia-lyase  32.5 
 
 
462 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0915  L-serine dehydratase 1  39.53 
 
 
455 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2941  L-serine ammonia-lyase  39.53 
 
 
455 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.73805  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02642  L-serine deaminase II  39.53 
 
 
455 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0891  L-serine dehydratase 1  39.53 
 
 
455 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0393995  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3296  L-serine dehydratase  33.99 
 
 
458 aa  48.5  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3740  L-serine dehydratase 1  41.43 
 
 
453 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.205833 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02604  hypothetical protein  39.53 
 
 
455 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3102  L-serine dehydratase 2  39.53 
 
 
455 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0654  L-serine dehydratase 1  34.29 
 
 
462 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344045  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4061  L-serine ammonia-lyase 2  39.53 
 
 
455 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830001  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1084  L-serine dehydratase 1  35.79 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3483  L-serine ammonia-lyase  33.55 
 
 
458 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0139  L-serine dehydratase 1  32.28 
 
 
462 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2937  L-serine ammonia-lyase 2  39.53 
 
 
455 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.427341  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3075  L-serine ammonia-lyase 2  39.53 
 
 
455 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2019  L-serine dehydratase 1  33.77 
 
 
454 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2940  L-serine dehydratase 1  37.65 
 
 
455 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.544189  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  32.26 
 
 
462 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2913  L-serine dehydratase 1  31.21 
 
 
462 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0129  L-serine dehydratase 1  40.7 
 
 
462 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0142  L-serine dehydratase 1  31.21 
 
 
462 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1955  L-serine ammonia-lyase  36 
 
 
504 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1863  L-serine ammonia-lyase  36 
 
 
504 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2383  L-serine ammonia-lyase  39.78 
 
 
454 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3038  L-serine ammonia-lyase  38.67 
 
 
459 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.883779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>