More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5570 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5570  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  100 
 
 
295 aa  599  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.260199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3067  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  94.58 
 
 
296 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.589265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3307  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  94.58 
 
 
296 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3287  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  94.58 
 
 
296 aa  524  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2483  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  94.92 
 
 
296 aa  524  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2834  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  57.88 
 
 
290 aa  324  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1073  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  59.93 
 
 
293 aa  323  3e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000230696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4208  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  57.39 
 
 
292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3892  L-serine dehydratase, alpha subunit  57.53 
 
 
292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4271  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  57.39 
 
 
292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0989  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  57.39 
 
 
292 aa  319  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4046  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  57.39 
 
 
292 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4360  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  57.39 
 
 
292 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4161  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  57.39 
 
 
292 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3884  L-serine dehydratase, alpha subunit  57.39 
 
 
292 aa  318  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4247  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  57.39 
 
 
292 aa  317  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2554  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  58.28 
 
 
299 aa  317  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2606  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  58.28 
 
 
299 aa  317  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1076  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  55.86 
 
 
297 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3970  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  56.7 
 
 
292 aa  316  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2094  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  58.08 
 
 
299 aa  315  5e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1966  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  56.21 
 
 
294 aa  309  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2146  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  52.05 
 
 
290 aa  267  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.284202  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0888  L-serine ammonia-lyase / 2-hydroxymethylglutarate dehydratase  51.72 
 
 
287 aa  263  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00304555  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1283  L-serine dehydratase alpha subunit  49.83 
 
 
289 aa  258  9e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.199144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1253  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  48.61 
 
 
294 aa  255  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2643  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  45.3 
 
 
293 aa  252  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1058  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  44.44 
 
 
292 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2960  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  44.95 
 
 
293 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1421  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  50.88 
 
 
297 aa  247  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316402  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1506  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  46.55 
 
 
296 aa  236  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0178055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1759  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  47.4 
 
 
291 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1246  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  46.49 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2854  L-serine ammonia-lyase  43.9 
 
 
304 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0174652 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16330  L-serine ammonia-lyase, alpha subunit  45.99 
 
 
288 aa  222  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.59813e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1459  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  42.61 
 
 
292 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000185683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0952  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  46.95 
 
 
536 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3835  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  45.68 
 
 
287 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0098  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  39.72 
 
 
291 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000117533  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10070  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  47.48 
 
 
541 aa  202  8e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000332749  hitchhiker  0.0000000458611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1474  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  38.75 
 
 
290 aa  199  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16320  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  46.77 
 
 
552 aa  199  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  hitchhiker  0.00195001 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1331  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  41.72 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.742186  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1946  L-serine ammonia-lyase  44.6 
 
 
313 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.426247  hitchhiker  0.000000256832 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0503  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  52.79 
 
 
549 aa  180  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.742023 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0337  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  39.3 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.794758  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0198  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  38.79 
 
 
283 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000157551  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2065  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  36.93 
 
 
293 aa  176  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000167711  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0267  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  38.55 
 
 
290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  36.79 
 
 
458 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10673  L-serine dehydratase  42.08 
 
 
477 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.436502  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  37.12 
 
 
470 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  35.79 
 
 
457 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2874  L-serine dehydratase 1  44.75 
 
 
457 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.30844  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12590  L-serine ammonia-lyase  36.57 
 
 
464 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.82368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0917  serine dehydratase alpha chain  36.7 
 
 
406 aa  149  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  44.62 
 
 
456 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2109  L-serine dehydratase 1  42.62 
 
 
472 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1077  L-serine dehydratase  43.65 
 
 
458 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  36.59 
 
 
458 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  36.59 
 
 
458 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  44.2 
 
 
458 aa  146  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4709  L-serine dehydratase 1  40.49 
 
 
475 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0213  L-serine dehydratase 1  35.69 
 
 
462 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  44.75 
 
 
473 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2070  serine dehydratase alpha chain  35 
 
 
403 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1962  L-serine ammonia-lyase / 2-hydroxymethylglutarate dehydratase  38.87 
 
 
457 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  36.46 
 
 
458 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  34.4 
 
 
469 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  37.55 
 
 
459 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  35.11 
 
 
458 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3620  L-serine dehydratase 1  36.19 
 
 
467 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.294532  normal  0.0574017 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  35.96 
 
 
499 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0679  L-serine dehydratase 1  34.14 
 
 
460 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  34.7 
 
 
458 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  38.22 
 
 
463 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01908  L-serine dehydratase 1  34.39 
 
 
453 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  35.02 
 
 
460 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  34.74 
 
 
455 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3111  L-serine ammonia-lyase  39.34 
 
 
404 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  36.77 
 
 
462 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003155  L-serine dehydratase  34.39 
 
 
453 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.225865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  45.3 
 
 
457 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0608  L-serine dehydratase 1  43.09 
 
 
476 aa  143  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2771  L-serine ammonia-lyase  38.75 
 
 
464 aa  143  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04899  L-serine dehydratase  42.54 
 
 
456 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04817  L-serine deaminase  43.09 
 
 
456 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  35.25 
 
 
458 aa  143  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0687  L-serine dehydratase 1  43.09 
 
 
453 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  44.2 
 
 
458 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  34.69 
 
 
458 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  45.3 
 
 
475 aa  142  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  34.52 
 
 
458 aa  142  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3144  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  37.36 
 
 
458 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000749  L-serine dehydratase  42.54 
 
 
456 aa  142  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360037  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  34.93 
 
 
458 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  35.71 
 
 
457 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  44.75 
 
 
462 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0897  L-serine dehydratase 1  33.22 
 
 
450 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266509  normal  0.482369 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4265  L-serine ammonia-lyase  36.78 
 
 
460 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>