More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5471 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  86.43 
 
 		 221 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  85.97 
 
 		 221 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  84.62 
 
 		 221 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  79.45 
 
 		 220 aa  362  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3617  two component transcriptional regulator  56.16 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5188  DNA-binding response regulator  56.16 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5173  DNA-binding response regulator  56.16 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4859  two component transcriptional regulator  56.16 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5179  DNA-binding response regulator  56.16 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4744  response regulator  56.16 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5144  DNA-binding response regulator  56.16 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4763  response regulator  56.16 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5275  DNA-binding response regulator  56.16 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4900  DNA-binding response regulator  55.71 
 
 		 221 aa  256  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0071  DNA-binding response regulator  55.71 
 
 		 221 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3209  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory proteinphoP  41.2 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  41.07 
 
 		 226 aa  188  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  38.05 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  41.7 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.29 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  41.23 
 
 		 230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  40.36 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  37.83 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 230 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  41.23 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  38.22 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  40.54 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.54 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.36 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  37.05 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0704  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00127495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  44.69 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  44.69 
 
 		 231 aa  177  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 236 aa  177  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 		 237 aa  177  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  37.72 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  42.47 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  38.29 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  42.92 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  42.92 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.57 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  39.64 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>