More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5466 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  100 
 
 
325 aa  679    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  53.21 
 
 
316 aa  338  9e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  53.53 
 
 
312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  54.4 
 
 
315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  52.43 
 
 
311 aa  324  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  54.07 
 
 
313 aa  322  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  51.61 
 
 
310 aa  322  6e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  51.62 
 
 
311 aa  321  9.000000000000001e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  52.65 
 
 
325 aa  306  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  50.32 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  48.31 
 
 
288 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  41.78 
 
 
314 aa  267  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  47.49 
 
 
287 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  46.33 
 
 
302 aa  256  5e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  42.26 
 
 
316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  39.2 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  43.34 
 
 
295 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  44.22 
 
 
303 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  40.82 
 
 
320 aa  225  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3061  homocysteine S-methyltransferase  37.58 
 
 
314 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30270  AdoMet-homocysteine methyltransferase  30.34 
 
 
337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39914  predicted protein  30.94 
 
 
418 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0674804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.2 
 
 
605 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03378  homocysteine S-methyltransferase (Eurofung)  26.82 
 
 
355 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  26.05 
 
 
804 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.25 
 
 
610 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  26.2 
 
 
801 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  26.99 
 
 
301 aa  93.6  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0627  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.03 
 
 
610 aa  93.2  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.07944e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  29.37 
 
 
804 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  30.56 
 
 
305 aa  92.8  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  29.68 
 
 
804 aa  92.8  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.17 
 
 
615 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  27.07 
 
 
1180 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02860  B12-dependent methionine synthase  27.24 
 
 
355 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  27.96 
 
 
819 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  25.25 
 
 
768 aa  90.1  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  25.32 
 
 
768 aa  89.4  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  27.06 
 
 
816 aa  88.6  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  26.48 
 
 
381 aa  88.6  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  27.42 
 
 
841 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  27.54 
 
 
629 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  25.08 
 
 
807 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  26.06 
 
 
800 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.78 
 
 
609 aa  86.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.33 
 
 
617 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.35 
 
 
604 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.537957  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  25.96 
 
 
413 aa  86.3  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  25.32 
 
 
1224 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  29.06 
 
 
310 aa  86.3  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  27 
 
 
804 aa  85.9  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.57 
 
 
605 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  25.77 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  26.47 
 
 
813 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  27.93 
 
 
1169 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  26.75 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  28.06 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.7 
 
 
605 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  28.75 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  27.19 
 
 
1178 aa  82.8  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  28.13 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  27.83 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0843  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.5 
 
 
611 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  27.83 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  26.32 
 
 
1230 aa  80.5  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  26.53 
 
 
806 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  26.73 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  27.52 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  28.94 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  26.71 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  23.93 
 
 
791 aa  79  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0460  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  27.81 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  27.63 
 
 
1232 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  26.71 
 
 
1250 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1406  homocysteine S-methyltransferase, putative  24.42 
 
 
279 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  25.24 
 
 
1196 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1670  homocysteine S-methyltransferase family protein  24.17 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  27.04 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  26.53 
 
 
811 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  26.36 
 
 
1171 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  28.29 
 
 
1169 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0358  homocysteine S-methyltransferase, putative  27.08 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3207  methionine synthase (B12-dependent)  26.53 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  24.6 
 
 
1208 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2828  homocysteine S-methyltransferase  27.38 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2931  homocysteine S-methyltransferase  27.61 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2302  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  27.61 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1268  homocysteine S-methyltransferase  24.29 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.897971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2965  methionine synthase  27.38 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2916  methionine synthase  27.61 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142976  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  26.9 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  25.78 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  24.18 
 
 
1225 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  24.33 
 
 
818 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  26.81 
 
 
1226 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  24.92 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1861  homocysteine S-methyltransferase  24.17 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000268518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  26.69 
 
 
801 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  26.5 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  26.13 
 
 
1228 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>