More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5211 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_5211  LytTR family two component transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5597  putative response regulator  90.34 
 
 		 238 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0176672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5546  response regulator, putative  90.34 
 
 		 238 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5512  putative response regulator  89.92 
 
 		 238 aa  447  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5270  response regulator  89.92 
 
 		 238 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5097  response regulator  89.5 
 
 		 238 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5114  response regulator  89.92 
 
 		 238 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5667  response regulator  89.92 
 
 		 238 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000414392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5410  putative response regulator  89.92 
 
 		 238 aa  428  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5541  putative response regulator  89.92 
 
 		 238 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3930  LytTR family two component transcriptional regulator  74.37 
 
 		 238 aa  368  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 240 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  31.43 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  31.43 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  31.43 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  31.43 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  31.43 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  31.43 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  31.43 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  31.98 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  29.49 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  30.61 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  31.02 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.43 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  28.05 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  29.72 
 
 		 250 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.42 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.02 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.94 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.09 
 
 		 268 aa  98.6  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.52 
 
 		 260 aa  98.2  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  27.71 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  28.74 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.59 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  27.76 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.27 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  29.36 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  29.36 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  29.36 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  29.36 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.36 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 257 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.61 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12140  response regulator of the LytR/AlgR family  28.64 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  26.44 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  27.31 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  27.31 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  25.3 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  26.64 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  26.25 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.05 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.91 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.68 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.91 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.91 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0388  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.68 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.91 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.91 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  27.64 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.98 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.98 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  27.24 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.24 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.24 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.24 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.24 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  27.24 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  25.9 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.24 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  23.72 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.24 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2766  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.57 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2025  two-component response regulator  29.25 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  27.01 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0746  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.94 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  25.73 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1924  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.79 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.27 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  23.9 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  29.46 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.79 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.91 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  25.59 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.59 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  25.59 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  25.59 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  25.59 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  25.59 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  25.59 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  25.59 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>