263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4986 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  100 
 
 
234 aa  488  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  75.21 
 
 
234 aa  374  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  75.64 
 
 
234 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  73.93 
 
 
234 aa  371  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  75.21 
 
 
234 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  63.68 
 
 
234 aa  316  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  74.07 
 
 
190 aa  299  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  75.66 
 
 
190 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  75.13 
 
 
190 aa  298  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  75.13 
 
 
190 aa  298  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  74.6 
 
 
190 aa  295  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  41.53 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  38.66 
 
 
235 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  32.49 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.79 
 
 
226 aa  112  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1189  amidophosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
216 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0407  late competence protein  33.19 
 
 
220 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00143489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 
229 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  33.33 
 
 
221 aa  100  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 
259 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  29.28 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  30.23 
 
 
230 aa  88.6  8e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  30.04 
 
 
246 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0792  hypothetical protein  27.9 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0624142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0775  hypothetical protein  27.9 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.572704  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  32.74 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  31.19 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  27.98 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  28.24 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  29.6 
 
 
243 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1333  amidophosphoribosyltransferase  26.29 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000118049  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0418  comF operon protein 3  29.17 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  30 
 
 
243 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
239 aa  78.2  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  28.37 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  31.05 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.22 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  26.56 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  25.65 
 
 
279 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  27.95 
 
 
273 aa  75.1  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  30 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  31.42 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  29.66 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  29.3 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.23 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  30.59 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  28.37 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  27.4 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  27.52 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  28.57 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  27.1 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  27.97 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.7 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.94 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  26.51 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  29.23 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  31.02 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  31.72 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  27.35 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.98 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  25.52 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  30.77 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  27.35 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.88 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  28.51 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  26.05 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  27.93 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  26.29 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  30.19 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  26.61 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  25 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  27.67 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  26.55 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  25.88 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  25.23 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  25.12 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  24.3 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  27.45 
 
 
238 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  26.97 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  26.87 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  24.64 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  28.11 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  24.77 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  23.5 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  26.55 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  24.15 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>