More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4982 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  48.13 
 
 
909 aa  834  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  46.62 
 
 
899 aa  801  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0194  preprotein translocase subunit SecA  47.91 
 
 
931 aa  806  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  44.01 
 
 
970 aa  752  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  53.96 
 
 
886 aa  941  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.96185e-05  hitchhiker  1.70911e-09 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  47.74 
 
 
912 aa  820  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  46.67 
 
 
934 aa  816  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  47.96 
 
 
936 aa  826  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  50.06 
 
 
901 aa  856  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.05239e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  46.93 
 
 
866 aa  795  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  47.91 
 
 
936 aa  839  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  45.45 
 
 
956 aa  716  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  47.15 
 
 
914 aa  804  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  47.78 
 
 
931 aa  846  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  47.62 
 
 
921 aa  836  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  47.26 
 
 
919 aa  840  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  47.59 
 
 
914 aa  811  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0287  preprotein translocase subunit SecA  46.39 
 
 
964 aa  748  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.196625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0511  preprotein translocase subunit SecA  42.87 
 
 
946 aa  723  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  48.62 
 
 
910 aa  823  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  53.98 
 
 
787 aa  843  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  96.41 
 
 
835 aa  1670  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1061  preprotein translocase subunit SecA  48.4 
 
 
788 aa  746  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.83291e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3540  preprotein translocase subunit SecA  47.39 
 
 
905 aa  810  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1220  preprotein translocase subunit SecA  44.91 
 
 
916 aa  748  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  50.06 
 
 
901 aa  857  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  48.17 
 
 
907 aa  828  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  48.44 
 
 
914 aa  856  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  49.39 
 
 
901 aa  845  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  49.39 
 
 
901 aa  845  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  44.36 
 
 
962 aa  770  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  50.33 
 
 
902 aa  863  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0990  preprotein translocase subunit SecA  44.87 
 
 
944 aa  737  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  49.39 
 
 
901 aa  848  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  49.39 
 
 
901 aa  845  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  49.39 
 
 
901 aa  845  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  47.73 
 
 
932 aa  845  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  47.81 
 
 
907 aa  833  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  4.05863e-05  unclonable  6.59986e-08 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  43.41 
 
 
963 aa  749  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  53.8 
 
 
859 aa  914  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  48.73 
 
 
1018 aa  763  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  48.51 
 
 
907 aa  842  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.17033e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  49.22 
 
 
910 aa  844  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  48.46 
 
 
907 aa  842  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  8.08939e-05  hitchhiker  2.70752e-06 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  50.52 
 
 
868 aa  832  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  50.06 
 
 
901 aa  856  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.73806e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  50.06 
 
 
901 aa  856  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.13856e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  48.55 
 
 
909 aa  822  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  46.96 
 
 
1024 aa  808  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  48.52 
 
 
916 aa  838  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0512  preprotein translocase, SecA subunit  44.83 
 
 
931 aa  773  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171651  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1730  preprotein translocase, SecA subunit  46.94 
 
 
935 aa  770  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  50.06 
 
 
869 aa  820  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  47.89 
 
 
884 aa  784  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  48.95 
 
 
904 aa  838  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3567  preprotein translocase subunit SecA  45.64 
 
 
908 aa  755  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0910  preprotein translocase, SecA subunit  49.83 
 
 
971 aa  830  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822535  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  47.65 
 
 
908 aa  835  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  8.62629e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  47.9 
 
 
911 aa  818  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  50.06 
 
 
901 aa  856  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.42397e-05  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1241  preprotein translocase subunit SecA  46.36 
 
 
871 aa  744  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00118655  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  50.06 
 
 
901 aa  856  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  48.95 
 
 
904 aa  838  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  49.72 
 
 
903 aa  885  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0922  preprotein translocase subunit SecA  45.1 
 
 
921 aa  771  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.666696  normal  0.803255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  48.12 
 
 
911 aa  822  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 
835 aa  1719  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  43.7 
 
 
970 aa  751  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  48.95 
 
 
904 aa  838  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  48.52 
 
 
913 aa  837  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  47.7 
 
 
932 aa  849  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0863  preprotein translocase subunit SecA  51.22 
 
 
824 aa  823  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0619112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  47.91 
 
 
915 aa  832  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  52.92 
 
 
858 aa  892  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  9.54938e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  47.84 
 
 
862 aa  777  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3738  preprotein translocase, SecA subunit  48.5 
 
 
947 aa  770  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361446  normal  0.764216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3628  preprotein translocase, SecA subunit  46.96 
 
 
950 aa  798  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0804577  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  46.4 
 
 
920 aa  798  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  49.72 
 
 
916 aa  845  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3262  preprotein translocase subunit SecA  48.41 
 
 
797 aa  730  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  73.74 
 
 
837 aa  1283  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  52.8 
 
 
888 aa  915  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1366  preprotein translocase, SecA subunit  50.48 
 
 
997 aa  782  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.779073  normal  0.444827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  49.53 
 
 
836 aa  827  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  53.14 
 
 
872 aa  947  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.11083e-06  unclonable  3.74715e-10 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  59.42 
 
 
796 aa  964  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2000  preprotein translocase, SecA subunit  44.67 
 
 
934 aa  759  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1814e-06 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  47.6 
 
 
916 aa  805  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1822  preprotein translocase, SecA subunit  48.33 
 
 
906 aa  763  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  50.88 
 
 
838 aa  845  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20600  protein translocase subunit secA  46.94 
 
 
985 aa  746  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.648191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  43.37 
 
 
945 aa  746  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  48.61 
 
 
909 aa  835  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  45.46 
 
 
954 aa  805  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  48.88 
 
 
859 aa  799  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0777  preprotein translocase subunit SecA  46.72 
 
 
933 aa  800  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648887  normal  0.618411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1081  preprotein translocase, SecA subunit  46.09 
 
 
917 aa  753  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2325  preprotein translocase, SecA subunit  49.64 
 
 
933 aa  789  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0666996  hitchhiker  1.17576e-05 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1857  preprotein translocase SecA subunit  47.8 
 
 
955 aa  766  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137741  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  45.03 
 
 
928 aa  786  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>