More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4919 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4919  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000171435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5235  DNA-binding response regulator  93.64 
 
 		 220 aa  427  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0048741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0006  DNA-binding response regulator  94.67 
 
 		 225 aa  421  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4954  DNA-binding response regulator  92.89 
 
 		 225 aa  411  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5331  DNA-binding response regulator  92.89 
 
 		 225 aa  411  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000933212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5227  DNA-binding response regulator  92 
 
 		 225 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4796  response regulator  90.22 
 
 		 225 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000140673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5198  DNA-binding response regulator  90.67 
 
 		 225 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5248  DNA-binding response regulator  90.22 
 
 		 225 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4816  response regulator  90.22 
 
 		 225 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000589569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 224 aa  192  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  44.34 
 
 		 219 aa  181  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 219 aa  181  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  41.92 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  40.99 
 
 		 229 aa  175  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 228 aa  174  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  39.65 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  39.38 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  36.16 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  38.57 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  38.57 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  38.57 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  38.12 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  33.93 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.91 
 
 		 223 aa  154  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0989  DNA-binding response regulator ArlR  42.53 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.59 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  36.16 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  38.01 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.84 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2339  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 236 aa  148  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.14 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  37.95 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6685  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.4 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  31.98 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.29 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3932  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2880  two component transcriptional regulator  35.45 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  35.45 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 242 aa  144  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  35.75 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0612  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.81 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  35.62 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  32.13 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.81 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.33 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>