More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4400 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4400  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4700  hypothetical protein  96.77 
 
 
217 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000255246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4684  hypothetical protein  95.39 
 
 
217 aa  384  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12554e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4465  hypothetical protein  95.39 
 
 
217 aa  384  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4300  multidrug resistance protein A  95.39 
 
 
217 aa  384  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000026909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4311  multidrug resistance protein A  95.39 
 
 
217 aa  384  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4693  hypothetical protein  95.39 
 
 
217 aa  384  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0560  hypothetical protein  94.93 
 
 
217 aa  384  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000264688  hitchhiker  1.67598e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4813  hypothetical protein  95.39 
 
 
217 aa  384  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0590873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4677  hypothetical protein  94.47 
 
 
217 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3255  multidrug resistance protein A  91.71 
 
 
217 aa  374  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2447  hypothetical protein  56.34 
 
 
212 aa  263  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1834  multidrug resistance protein A  56.34 
 
 
212 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00170419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2429  Multidrug resistance efflux pump-like protein  49.3 
 
 
214 aa  226  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.310054  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2423  hypothetical protein  43.26 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2377  hypothetical protein  43.26 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2910  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  44.39 
 
 
228 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1945  drug transporter, putative  42.49 
 
 
215 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2323  secretion protein HlyD  34.3 
 
 
231 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000671168  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2016  secretion protein HlyD family protein  34.91 
 
 
517 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4149  hypothetical protein  32.56 
 
 
218 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.247441  hitchhiker  0.00000117092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0454  secretion protein HlyD  31.28 
 
 
217 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0099  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  30.37 
 
 
220 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  42.64 
 
 
400 aa  101  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  41.73 
 
 
325 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  36.8 
 
 
394 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  35.2 
 
 
358 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  45.37 
 
 
373 aa  96.7  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  40.83 
 
 
390 aa  95.5  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  36.72 
 
 
344 aa  94.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  35.2 
 
 
301 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  42.06 
 
 
373 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  32.94 
 
 
395 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 
351 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 
351 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 
351 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  34.92 
 
 
332 aa  92  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 
344 aa  92  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  34.07 
 
 
364 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 
351 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  34.13 
 
 
352 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  34.13 
 
 
352 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  34.13 
 
 
352 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  33.59 
 
 
377 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  40.66 
 
 
351 aa  89  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  34.13 
 
 
352 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  40.74 
 
 
374 aa  88.6  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 
383 aa  88.6  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  37.96 
 
 
375 aa  88.2  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  39.09 
 
 
371 aa  88.2  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  33.33 
 
 
372 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.92 
 
 
387 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  38.28 
 
 
346 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  32.34 
 
 
363 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 
387 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  35.78 
 
 
352 aa  87  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 
402 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  29 
 
 
383 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0561  secretion protein HlyD family protein  37.4 
 
 
348 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  37.25 
 
 
371 aa  86.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
352 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  40 
 
 
355 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  36.22 
 
 
328 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  36.67 
 
 
468 aa  85.9  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  34.11 
 
 
375 aa  85.9  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  38.98 
 
 
422 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1624  HlyD family secretion protein  34.4 
 
 
395 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0883  multidrug resistance protein, putative  34.4 
 
 
395 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0690  putative multidrug resistance protein  34.4 
 
 
395 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1802  HlyD family secretion protein  34.4 
 
 
395 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0468  putative multidrug resistance protein  34.4 
 
 
395 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1644  HlyD family secretion protein  34.4 
 
 
395 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1408  putative multidrug resistance protein  34.4 
 
 
395 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  34.11 
 
 
366 aa  85.1  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  37.3 
 
 
443 aa  85.1  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  39.09 
 
 
401 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  34.71 
 
 
385 aa  84.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 
389 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  33.08 
 
 
390 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 
347 aa  84.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  34.68 
 
 
460 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  35.16 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  37.27 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  37.27 
 
 
475 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  37.27 
 
 
475 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  35.78 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  37.72 
 
 
388 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  39.62 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  35.66 
 
 
331 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  38.18 
 
 
401 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  34.68 
 
 
460 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  41.28 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  33.94 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  32.8 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 
394 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  37.4 
 
 
385 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  34.86 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  32.8 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>