More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4235 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
876 aa  740    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
876 aa  738    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0050  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
871 aa  668    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
875 aa  759    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
874 aa  731    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 
876 aa  1040    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
867 aa  755    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
884 aa  679    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  98.64 
 
 
880 aa  1791    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
876 aa  714    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0613  alanyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 
842 aa  646    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
872 aa  894    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
885 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
874 aa  741    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
874 aa  771    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  98.3 
 
 
880 aa  1784    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  98.75 
 
 
880 aa  1792    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl613  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
892 aa  679    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  98.75 
 
 
880 aa  1793    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
874 aa  712    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
860 aa  709    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
860 aa  709    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
899 aa  755    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1460  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
890 aa  670    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.124208  hitchhiker  0.00581407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
871 aa  700    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
889 aa  647    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
874 aa  716    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
874 aa  720    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
886 aa  677    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
891 aa  673    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
880 aa  677    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
874 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  44.28 
 
 
873 aa  704    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
874 aa  729    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
879 aa  728    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
882 aa  771    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
897 aa  723    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2173  alanyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
899 aa  665    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
863 aa  754    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
876 aa  766    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
880 aa  754    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
864 aa  767    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  98.3 
 
 
880 aa  1784    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1898  alanyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
851 aa  641    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.352865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
886 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
899 aa  679    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
862 aa  695    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0159  alanyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
896 aa  667    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 
874 aa  704    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
881 aa  786    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
874 aa  706    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
905 aa  699    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0534  alanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
842 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
891 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
872 aa  681    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
876 aa  691    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
875 aa  740    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
890 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
874 aa  693    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
878 aa  677    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
874 aa  718    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
874 aa  737    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
891 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
868 aa  725    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
897 aa  672    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
890 aa  699    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
884 aa  737    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
874 aa  662    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2201  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
885 aa  655    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
902 aa  644    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
897 aa  726    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
865 aa  748    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3035  alanyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
948 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12081  normal  0.0855444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 
877 aa  655    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
879 aa  751    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
879 aa  751    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
874 aa  756    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
874 aa  711    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
874 aa  740    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
874 aa  738    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
869 aa  721    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 
874 aa  741    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
880 aa  754    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1008  alanyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
884 aa  652    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
874 aa  726    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
874 aa  769    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
872 aa  900    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1167  alanyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
885 aa  913    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  54.54 
 
 
882 aa  951    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0556  alanyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
893 aa  897    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 
872 aa  877    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
897 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
885 aa  756    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
878 aa  717    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
874 aa  739    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1029  alanyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
845 aa  637    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00361534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
878 aa  751    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
880 aa  684    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
876 aa  736    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
900 aa  737    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>