More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4026 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  94.47 
 
 
583 aa  1118    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  94.47 
 
 
579 aa  1118    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  94.47 
 
 
579 aa  1117    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  94.13 
 
 
579 aa  1115    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  94.47 
 
 
583 aa  1118    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  94.99 
 
 
579 aa  1123    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  94.47 
 
 
579 aa  1117    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  94.65 
 
 
579 aa  1120    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  62.06 
 
 
573 aa  724    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  94.47 
 
 
579 aa  1117    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  100 
 
 
579 aa  1178    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  91.02 
 
 
579 aa  1065    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  60.31 
 
 
573 aa  708    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  46.94 
 
 
559 aa  497  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  44.33 
 
 
555 aa  481  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  42.86 
 
 
556 aa  450  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  43.76 
 
 
552 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  41.59 
 
 
566 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  42.4 
 
 
559 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  42.4 
 
 
559 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  41.61 
 
 
558 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  41.49 
 
 
554 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  39.86 
 
 
555 aa  413  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  40.46 
 
 
558 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  39.51 
 
 
570 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  39.13 
 
 
565 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  39.13 
 
 
565 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  37.91 
 
 
567 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  38.45 
 
 
562 aa  392  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  38.1 
 
 
555 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  37.18 
 
 
577 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  38.46 
 
 
565 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  37.61 
 
 
562 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  40.17 
 
 
565 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  38.84 
 
 
551 aa  377  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  38.1 
 
 
556 aa  379  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  38.49 
 
 
601 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
553 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.84 
 
 
554 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  37.44 
 
 
557 aa  371  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  37.84 
 
 
586 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  35.18 
 
 
580 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  38.66 
 
 
553 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  38.09 
 
 
599 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.53 
 
 
572 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  34.87 
 
 
561 aa  352  8.999999999999999e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  36.46 
 
 
560 aa  351  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 
561 aa  344  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  38.22 
 
 
553 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  36.86 
 
 
587 aa  343  7e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  37.24 
 
 
552 aa  342  8e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  34.66 
 
 
572 aa  341  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  34.21 
 
 
569 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  34.78 
 
 
588 aa  336  5.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  35.09 
 
 
574 aa  336  5.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 
551 aa  336  7.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 
578 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  34.77 
 
 
588 aa  333  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  34.25 
 
 
588 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  37.44 
 
 
558 aa  330  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  34.97 
 
 
560 aa  326  7e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  35.07 
 
 
554 aa  325  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  35.11 
 
 
575 aa  323  4e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  33.97 
 
 
574 aa  323  6e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  35.19 
 
 
560 aa  323  7e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  37.06 
 
 
572 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  34.26 
 
 
574 aa  319  7e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  34.32 
 
 
567 aa  319  9e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  34.06 
 
 
582 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 
605 aa  318  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  35.36 
 
 
554 aa  317  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 
567 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 
558 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 
568 aa  313  7.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  34.55 
 
 
554 aa  312  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0450  DNA repair protein RecN  35.35 
 
 
558 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0611  DNA repair protein RecN  35.35 
 
 
558 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 
557 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 
556 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  33.39 
 
 
552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  32.14 
 
 
559 aa  309  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  32.31 
 
 
575 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  33.39 
 
 
552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  32.64 
 
 
567 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  35.29 
 
 
561 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  34.78 
 
 
561 aa  306  8.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  32.23 
 
 
552 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  32.5 
 
 
586 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  34.93 
 
 
559 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  32.56 
 
 
557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  34.93 
 
 
559 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 
551 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  32.11 
 
 
595 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 
562 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 
561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  31.1 
 
 
593 aa  304  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 
558 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  33.1 
 
 
552 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  33.04 
 
 
552 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  32.69 
 
 
553 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>