234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3953 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  95.62 
 
 
457 aa  815    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  95.62 
 
 
457 aa  815    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4193  Na+/H+ antiporter NhaC  96.72 
 
 
457 aa  800    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4256  Na+/H+ antiporter NhaC  96.94 
 
 
457 aa  800    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4030  Na+/H+ antiporter NhaC  97.16 
 
 
457 aa  802    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.623571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3863  Na+/H+ antiporter  96.94 
 
 
457 aa  800    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3877  Na+/H+ antiporter  96.94 
 
 
457 aa  800    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.335407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4345  Na+/H+ antiporter NhaC  97.16 
 
 
457 aa  802    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4146  Na+/H+ antiporter NhaC  97.16 
 
 
457 aa  802    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  91.25 
 
 
457 aa  810    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3953  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 
457 aa  891    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1829  Na+/H+ antiporter NhaC  46.8 
 
 
461 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1496  Na+/H+ antiporter  46.06 
 
 
458 aa  389  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011565  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  41.5 
 
 
474 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0166  Na+/H+ antiporter NhaC  42.69 
 
 
472 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2476  Na+/H+ antiporter NhaC  43.76 
 
 
502 aa  332  7.000000000000001e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.629323  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  41.36 
 
 
470 aa  331  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0896  Na+/H+ antiporter NhaC  41.23 
 
 
489 aa  330  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0388  Na+/H+ antiporter NhaC  40.33 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0450556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0310  Na+/H+ antiporter  40.09 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.186537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0313  Na+/H+ antiporter  40.09 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000868354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4931  Na+/H+ antiporter NhaC  40.56 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.312276  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0321  Na+/H+ antiporter NhaC  40.09 
 
 
473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4486  Na+/H+ antiporter NhaC  39.12 
 
 
514 aa  327  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0490  Na+/H+ antiporter NhaC  39.33 
 
 
499 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  40.7 
 
 
484 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0435  Na+/H+ antiporter NhaC  39.63 
 
 
473 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00534613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0326  Na+/H+ antiporter NhaC  39.86 
 
 
473 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000241995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0372  Na+/H+ antiporter NhaC  39.86 
 
 
473 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0341  Na+/H+ antiporter NhaC  39.86 
 
 
473 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142546  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0435  Na+/H+ antiporter NhaC  39.63 
 
 
473 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0475  Na+/H+ antiporter NhaC  40.58 
 
 
505 aa  322  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2723  Na+/H+ antiporter NhaC  39.65 
 
 
472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0475  Na+/H+ antiporter NhaC  39.68 
 
 
509 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03793  Na+/H+ antiporter, NhaC family protein  39.11 
 
 
495 aa  318  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  38.62 
 
 
494 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2457  Na+/H+ antiporter NhaC  39.2 
 
 
494 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0548  Na+/H+ antiporter NhaC  40.49 
 
 
510 aa  317  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0362545  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  38.52 
 
 
496 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3226  Na+/H+ antiporter NhaC  40.18 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0344  Na+/H+ antiporter NhaC  38.84 
 
 
506 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2006  Na+/H+ antiporter  40.45 
 
 
451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.16502  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3649  Na+/H+ antiporter NhaC  39.51 
 
 
488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3405  Na+/H+ antiporter NhaC  37.67 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.190303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1995  Na+/H+ antiporter NhaC  40.37 
 
 
506 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00594855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2832  Na+/H+ antiporter NhaC  38.98 
 
 
496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  40.05 
 
 
491 aa  306  7e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2809  Na+/H+ antiporter NhaC  39.77 
 
 
492 aa  305  8.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0607804  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1400  Na+/H+ antiporter NhaC  37.68 
 
 
509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.226086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1725  Na+/H+ antiporter NhaC  37.94 
 
 
482 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0133  NahC family Na(+)/H(+) antiporter  38.52 
 
 
496 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3531  Na+/H+ antiporter NhaC  39.13 
 
 
477 aa  299  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0661235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2609  Na+/H+ antiporter NhaC  37.58 
 
 
478 aa  299  8e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  37.1 
 
 
482 aa  298  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0226  Na+/H+ antiporter NhaC  37.61 
 
 
494 aa  291  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117171  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1834  Na+/H+ antiporter NhaC  40.83 
 
 
463 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00796766  normal  0.538801 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  36.51 
 
 
474 aa  290  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0736  Na+/H+ antiporter NhaC  34.39 
 
 
467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000132088  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2552  Na+/H+ antiporter NhaC  38.24 
 
 
463 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0461  Na+/H+ antiporter NhaC  35.28 
 
 
483 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0177  Na+/H+ antiporter NhaC  36.59 
 
 
471 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286543  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1415  Na+/H+ antiporter NhaC  36.98 
 
 
502 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2296  Na+/H+ antiporter NhaC  36.2 
 
 
487 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.634393 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0184  Na+/H+ antiporter NhaC  37.23 
 
 
470 aa  273  6e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0528403  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4039  Na+/H+ antiporter NhaC  35.11 
 
 
491 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2709  Na+/H+ antiporter NhaC  36.21 
 
 
480 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1609  sodium/proton antiporter  36.63 
 
 
484 aa  259  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0273  Na+/H+ antiporter NhaC  34.08 
 
 
475 aa  259  9e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  34.4 
 
 
488 aa  258  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  34.63 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  34.88 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  34.63 
 
 
467 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12540  Na+ antiporter NhaC  35.38 
 
 
475 aa  253  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.859822 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  34.88 
 
 
467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  33.26 
 
 
467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  34.63 
 
 
467 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  34.63 
 
 
467 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  34.63 
 
 
467 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  34.63 
 
 
467 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  34.63 
 
 
467 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1400  Na+/H+ antiporter NhaC  36.13 
 
 
510 aa  251  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000509696  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002927  Na+/H+ antiporter NhaC  31.65 
 
 
477 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0434616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  34.47 
 
 
467 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1622  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 
481 aa  249  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03022  Na+/H+ antiporter  31.65 
 
 
478 aa  249  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2651  Na+/H+ antiporter NhaC  31.51 
 
 
464 aa  249  8e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1856  Na+/H+ antiporter NhaC  32.46 
 
 
484 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1967  Na+/H+ antiporter NhaC  32.46 
 
 
484 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0793  Na(+)/H(+) antiporter  33.12 
 
 
469 aa  242  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1733  Na+/H+ antiporter NhaC  32.82 
 
 
483 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1668  Na+/H+ antiporter NhaC  32.82 
 
 
483 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1670  Na+/H+ antiporter NhaC  32.82 
 
 
483 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1609  Na+/H+ antiporter NhaC  32.82 
 
 
483 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1787  Na+/H+ antiporter NhaC  32.59 
 
 
483 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12548  Na+/H+ antiporter  34.44 
 
 
501 aa  239  6.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.678652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2324  Na+/H+ antiporter NhaC  35.87 
 
 
466 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2367  Na+/H+ antiporter NhaC  35.63 
 
 
466 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3617  Na+/H+ antiporter NhaC  32.16 
 
 
479 aa  235  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4869  Na+/H+ antiporter IbeT  32.03 
 
 
467 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1881  Na+/H+ antiporter NhaC  33.42 
 
 
465 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>