More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3731 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  100 
 
 
239 aa  484  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  97.91 
 
 
239 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  97.91 
 
 
239 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  97.91 
 
 
239 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  97.91 
 
 
239 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  97.91 
 
 
239 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  97.91 
 
 
239 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  97.91 
 
 
239 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  97.91 
 
 
239 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  97.91 
 
 
239 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  95.82 
 
 
239 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  84.94 
 
 
239 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  84.52 
 
 
239 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  78.9 
 
 
249 aa  357  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  74.03 
 
 
241 aa  348  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  72.49 
 
 
235 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  72.49 
 
 
235 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  72.34 
 
 
241 aa  335  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  69.33 
 
 
241 aa  335  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  75.7 
 
 
243 aa  332  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  73.28 
 
 
239 aa  330  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  68.49 
 
 
243 aa  328  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  78.5 
 
 
249 aa  328  6e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  67.36 
 
 
244 aa  320  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  73.83 
 
 
241 aa  320  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  71.63 
 
 
242 aa  313  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  70.89 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  64.14 
 
 
245 aa  308  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  66.1 
 
 
246 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  64.22 
 
 
244 aa  298  7e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  53.33 
 
 
234 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  50.25 
 
 
256 aa  218  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  52.86 
 
 
236 aa  208  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  47.39 
 
 
231 aa  208  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  51.56 
 
 
226 aa  206  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  50.5 
 
 
236 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  48.34 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  47.8 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  49.5 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  45.28 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  47.98 
 
 
239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  45.28 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  47.03 
 
 
237 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  47.03 
 
 
237 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  47.03 
 
 
237 aa  191  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  47.03 
 
 
237 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  47.03 
 
 
237 aa  191  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  47.03 
 
 
237 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  47.03 
 
 
237 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  47.03 
 
 
237 aa  191  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  47.03 
 
 
265 aa  191  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  47.03 
 
 
237 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  46.3 
 
 
219 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  43.69 
 
 
249 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  45.5 
 
 
232 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  47.4 
 
 
207 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  55.93 
 
 
149 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  59.38 
 
 
114 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  57.14 
 
 
118 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  44.64 
 
 
118 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  50.54 
 
 
126 aa  105  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  32.93 
 
 
255 aa  101  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  30.83 
 
 
257 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  31.47 
 
 
255 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  30.65 
 
 
256 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  30.77 
 
 
257 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0064  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  31.23 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.534501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  32.95 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  31.25 
 
 
232 aa  98.6  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  41.67 
 
 
113 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  30.24 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  32.51 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  31.51 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.68 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  29.84 
 
 
256 aa  95.9  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  30.65 
 
 
257 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3119  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.3 
 
 
326 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  30.45 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  29.62 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3432  RNA polymerase sigma-38 factor  29.69 
 
 
326 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2749  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.3 
 
 
326 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  30.58 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3212  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.3 
 
 
330 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.487557  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  31.69 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002516  RNA polymerase sigma factor RpoS  28.91 
 
 
328 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03517  hypothetical protein  28.91 
 
 
328 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1123  RNA polymerase, sigma 28 subunit  29.69 
 
 
326 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1194  RNA polymerase, sigma 28 subunit  29.69 
 
 
326 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1124  RNA polymerase, sigma 38 subunit, RpoS  29.69 
 
 
326 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1427  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.72 
 
 
336 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.818946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  29.89 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  30.27 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1213  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.25 
 
 
324 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3271  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.3 
 
 
326 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.589431  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1245  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  29.3 
 
 
326 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.411027  unclonable  0.00000000000310525 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3128  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.3 
 
 
326 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  30.27 
 
 
292 aa  92  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  32.26 
 
 
256 aa  92.4  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07020  sporulation sigma factor SigF  31.58 
 
 
257 aa  92  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0872  RNA polymerase sigma factor RpoS  28.91 
 
 
330 aa  91.7  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>