More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3660 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  93.39 
 
 
257 aa  463  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  92.61 
 
 
257 aa  461  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  92.22 
 
 
257 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  92.61 
 
 
257 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  90.27 
 
 
257 aa  457  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  91.05 
 
 
257 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  91.05 
 
 
257 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  90.27 
 
 
257 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  91.44 
 
 
257 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  82.03 
 
 
259 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  61.72 
 
 
277 aa  333  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  53.91 
 
 
260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  52.99 
 
 
253 aa  262  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  53.39 
 
 
253 aa  251  8.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  58.88 
 
 
256 aa  237  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  49.8 
 
 
255 aa  237  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  49.41 
 
 
255 aa  232  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  49.41 
 
 
255 aa  232  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  46.22 
 
 
256 aa  231  8.000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  47.41 
 
 
250 aa  227  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  51.53 
 
 
256 aa  226  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  49.22 
 
 
260 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  51.38 
 
 
258 aa  219  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  51.17 
 
 
255 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  42.19 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  52.25 
 
 
254 aa  211  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  49.78 
 
 
255 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  53.23 
 
 
230 aa  208  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  50.25 
 
 
217 aa  207  1e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  51.92 
 
 
216 aa  205  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  50 
 
 
242 aa  204  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  53.12 
 
 
210 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  55.91 
 
 
204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  47.62 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  43.14 
 
 
308 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  42.17 
 
 
338 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  55.91 
 
 
212 aa  195  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  54.79 
 
 
208 aa  194  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  55.43 
 
 
206 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  43.61 
 
 
283 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  54.05 
 
 
211 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  52.5 
 
 
230 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  43.61 
 
 
283 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  53.85 
 
 
198 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  48.79 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  44.05 
 
 
283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  48.79 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  50.75 
 
 
232 aa  189  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1153  ribonuclease HII  55.43 
 
 
206 aa  189  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344887  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  53.12 
 
 
213 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  51.79 
 
 
222 aa  187  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  49.75 
 
 
213 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  48.76 
 
 
214 aa  187  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  54.4 
 
 
203 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  54.1 
 
 
198 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  51.53 
 
 
208 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  55.25 
 
 
198 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  53.85 
 
 
227 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50.81 
 
 
240 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  48.99 
 
 
206 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  52.46 
 
 
198 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  51.06 
 
 
207 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  53.33 
 
 
198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  53.33 
 
 
198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  53.33 
 
 
198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  54.1 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  50.54 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  47.21 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  52.22 
 
 
198 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  52.78 
 
 
198 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  47.21 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  52.78 
 
 
198 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  48.65 
 
 
197 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  52.78 
 
 
198 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  52.78 
 
 
198 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  52.78 
 
 
198 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  52.78 
 
 
198 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  52.78 
 
 
198 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  52.78 
 
 
198 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  51.93 
 
 
218 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  46.7 
 
 
211 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  50.82 
 
 
198 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2694  ribonuclease HII  53.68 
 
 
209 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.529016  hitchhiker  0.00296162 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  50.82 
 
 
198 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  50.82 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  46.39 
 
 
198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  51.61 
 
 
197 aa  178  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  51.56 
 
 
238 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  51.56 
 
 
238 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  51.89 
 
 
269 aa  178  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  50 
 
 
211 aa  178  5.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  50.27 
 
 
201 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1495  ribonuclease HII  55.26 
 
 
210 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0185949  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  50.27 
 
 
198 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  55.74 
 
 
212 aa  178  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  50 
 
 
205 aa  178  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2888  ribonuclease HII  53.2 
 
 
210 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0614829  normal  0.459177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  52.22 
 
 
198 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  51.65 
 
 
248 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>