More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3640 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  72.59 
 
 		 1435 aa  2204    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  97 
 
 		 1433 aa  2904    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  48.84 
 
 		 1447 aa  1202    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  58.46 
 
 		 1436 aa  1717    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  47.81 
 
 		 1390 aa  1086    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  97.03 
 
 		 483 aa  966    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  96.38 
 
 		 970 aa  1942    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  49.86 
 
 		 1468 aa  1454    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  100 
 
 		 1433 aa  2974    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  39.86 
 
 		 1442 aa  912    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  96.58 
 
 		 1433 aa  2894    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  48.79 
 
 		 1442 aa  1328    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  96.65 
 
 		 1433 aa  2897    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  40.6 
 
 		 1493 aa  1036    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  52.19 
 
 		 1402 aa  1274    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  96.58 
 
 		 1433 aa  2894    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  58.93 
 
 		 1438 aa  1732    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  48.27 
 
 		 1527 aa  1155    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  43.48 
 
 		 1465 aa  995    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  53.11 
 
 		 1407 aa  1343    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  54.16 
 
 		 1426 aa  1378    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  96.51 
 
 		 1433 aa  2896    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  96.58 
 
 		 1433 aa  2894    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  40.83 
 
 		 1479 aa  1061    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  54.76 
 
 		 1214 aa  961    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  70.27 
 
 		 1444 aa  2139    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  37.11 
 
 		 1438 aa  910    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  49.41 
 
 		 1397 aa  1299    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  55.81 
 
 		 1440 aa  1420    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  93.51 
 
 		 1433 aa  2816    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  97 
 
 		 1433 aa  2904    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  54.62 
 
 		 1449 aa  1367    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  54.62 
 
 		 1449 aa  1367    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  96.58 
 
 		 1433 aa  2894    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  43.49 
 
 		 1365 aa  1039    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  47.27 
 
 		 1421 aa  1126    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  55.05 
 
 		 1212 aa  951    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  47.92 
 
 		 1367 aa  1119    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  47.12 
 
 		 1362 aa  1070    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  55.36 
 
 		 1635 aa  1404    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  45.72 
 
 		 1437 aa  1247    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  51.36 
 
 		 1432 aa  1475    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  48.79 
 
 		 1437 aa  1403    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  49.38 
 
 		 1464 aa  1449    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  47.76 
 
 		 1367 aa  1113    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  58.93 
 
 		 1438 aa  1732    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  55.5 
 
 		 1210 aa  965    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  44.9 
 
 		 1388 aa  1043    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  53.7 
 
 		 1433 aa  1336    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  53.89 
 
 		 1443 aa  1606    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  39.39 
 
 		 989 aa  596  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1148 aa  171  8e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  24.51 
 
 		 1170 aa  166  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  24.58 
 
 		 1240 aa  164  8.000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  23.13 
 
 		 1148 aa  164  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  24.4 
 
 		 1170 aa  162  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  25.05 
 
 		 1167 aa  156  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  24.28 
 
 		 1130 aa  155  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  23.75 
 
 		 1179 aa  154  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  23.7 
 
 		 1181 aa  153  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  24.56 
 
 		 1165 aa  152  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  24.7 
 
 		 1145 aa  151  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  23.43 
 
 		 1127 aa  151  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  23.89 
 
 		 1156 aa  148  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  25.68 
 
 		 1170 aa  147  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.8 
 
 		 1122 aa  146  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  22.87 
 
 		 1454 aa  146  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  23.67 
 
 		 1139 aa  146  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  24.87 
 
 		 1180 aa  146  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  22.58 
 
 		 1156 aa  146  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  23.42 
 
 		 1184 aa  145  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  23.14 
 
 		 1510 aa  145  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  23.39 
 
 		 1225 aa  145  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  23.66 
 
 		 1155 aa  144  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  24.04 
 
 		 1165 aa  144  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  23.03 
 
 		 1132 aa  144  9e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  39.8 
 
 		 551 aa  144  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  23.54 
 
 		 1139 aa  142  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  23.65 
 
 		 1157 aa  143  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  38.78 
 
 		 584 aa  141  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.07 
 
 		 921 aa  139  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  25.48 
 
 		 1607 aa  139  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  22.97 
 
 		 1155 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  23.59 
 
 		 1155 aa  137  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  22.51 
 
 		 1164 aa  136  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.56 
 
 		 584 aa  135  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.87 
 
 		 595 aa  135  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  22.44 
 
 		 1176 aa  135  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  23.39 
 
 		 1145 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  23.51 
 
 		 1153 aa  134  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  23.86 
 
 		 1476 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  40 
 
 		 565 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  42 
 
 		 560 aa  132  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  22.85 
 
 		 1175 aa  132  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  23.88 
 
 		 1182 aa  132  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  35.38 
 
 		 570 aa  131  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03222  DNA polymerase III subunit alpha  23.08 
 
 		 1143 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.11 
 
 		 1134 aa  130  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  23.3 
 
 		 1173 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1296  DNA polymerase III, alpha subunit  23.11 
 
 		 1181 aa  130  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>