222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3241 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  100 
 
 
281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  88.61 
 
 
281 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  88.61 
 
 
281 aa  520  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  88.61 
 
 
281 aa  520  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  88.26 
 
 
281 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  88.17 
 
 
281 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  87.1 
 
 
281 aa  511  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  86.02 
 
 
281 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  87.1 
 
 
281 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3593  exonuclease  88.02 
 
 
242 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0507  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.31 
 
 
215 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.589563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  26.67 
 
 
574 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  26.04 
 
 
584 aa  70.1  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  30.81 
 
 
1442 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  31.07 
 
 
578 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  33.15 
 
 
1367 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  28.49 
 
 
1421 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  33.15 
 
 
1367 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2409  exonuclease family protein  27.13 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.16874  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003555  hypothetical protein  25.7 
 
 
176 aa  63.5  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.014978  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.78 
 
 
605 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  30 
 
 
1388 aa  62.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.11 
 
 
260 aa  62.8  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2121  exonuclease family protein  27.13 
 
 
300 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  28.74 
 
 
719 aa  62.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  32.43 
 
 
585 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  28.49 
 
 
603 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  26.37 
 
 
183 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02516  hypothetical protein  25.14 
 
 
176 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0992  hypothetical protein  25.7 
 
 
176 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  27.22 
 
 
574 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  27.38 
 
 
570 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.68 
 
 
595 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  25.27 
 
 
192 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  26.37 
 
 
183 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1885  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.67 
 
 
204 aa  60.1  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.491413  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1823  putative exonuclease  26.26 
 
 
184 aa  59.7  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.32 
 
 
610 aa  59.7  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  28.42 
 
 
601 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  28 
 
 
769 aa  58.9  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  28.4 
 
 
232 aa  58.5  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.82 
 
 
960 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  31.49 
 
 
1397 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  27.57 
 
 
1449 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  26.09 
 
 
1449 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  31.4 
 
 
1390 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  27.06 
 
 
551 aa  57  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2251  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.49 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517325  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1341  DNA polymerase III subunit epsilon  29.55 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1848  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.4 
 
 
239 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0007  YacC  24.16 
 
 
282 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292935  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  28.82 
 
 
1407 aa  57  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  30.46 
 
 
645 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.04 
 
 
565 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  26.86 
 
 
1433 aa  55.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1770  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.49 
 
 
229 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.74 
 
 
218 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  28.25 
 
 
630 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.95 
 
 
205 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  28.25 
 
 
630 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  28.57 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  30.13 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  29.68 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  27.78 
 
 
1465 aa  54.3  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  28.57 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 
237 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  28.25 
 
 
630 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  27.1 
 
 
185 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.34 
 
 
183 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  28.39 
 
 
207 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  28.39 
 
 
207 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  28.4 
 
 
194 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.92 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3286  hypothetical protein  30.43 
 
 
607 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.74 
 
 
235 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1750  DNA polymerase III subunit epsilon  28.42 
 
 
195 aa  53.5  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0163231  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.32 
 
 
631 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  24.32 
 
 
315 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  27.68 
 
 
1527 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  25.95 
 
 
182 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  25.81 
 
 
183 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.22 
 
 
944 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.54 
 
 
226 aa  53.1  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.49 
 
 
178 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  24.32 
 
 
315 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.49 
 
 
208 aa  52.8  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  28.65 
 
 
1362 aa  52.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.27 
 
 
181 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.59 
 
 
609 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2410  DNA-directed DNA polymerase  27.87 
 
 
208 aa  52.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00000352729 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1999  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.79 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  23.36 
 
 
315 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.26 
 
 
721 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  24.31 
 
 
1440 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  27.5 
 
 
180 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  24.72 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  26.13 
 
 
1437 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.39 
 
 
201 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0726  DNA polymerase III subunit epsilon  29.41 
 
 
273 aa  52  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2245  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.7 
 
 
212 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>