More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3175 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 
472 aa  936    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  30 
 
 
496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  29.61 
 
 
447 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  29.16 
 
 
447 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  29.52 
 
 
452 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  28.93 
 
 
449 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  26.97 
 
 
455 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
455 aa  179  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  29.53 
 
 
447 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  28.22 
 
 
454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  28.41 
 
 
449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  28.24 
 
 
466 aa  172  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
447 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  28.47 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  27.52 
 
 
451 aa  167  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  31 
 
 
454 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  27.1 
 
 
450 aa  162  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  29.82 
 
 
467 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
448 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
452 aa  160  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.57 
 
 
456 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  26.96 
 
 
460 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  27.09 
 
 
442 aa  157  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  26.68 
 
 
449 aa  156  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  26.65 
 
 
448 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  27.92 
 
 
464 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  26.39 
 
 
451 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  26.39 
 
 
451 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  26.42 
 
 
450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  26.03 
 
 
458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  26.39 
 
 
451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  26.42 
 
 
450 aa  154  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  26.42 
 
 
450 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  25.99 
 
 
445 aa  152  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.16 
 
 
451 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
452 aa  149  8e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
439 aa  149  8e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  28.22 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  27.36 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  29.67 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  27.36 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0674  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.43 
 
 
473 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.12873  hitchhiker  0.000100797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25 
 
 
455 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  28.86 
 
 
447 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  27.59 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  27.83 
 
 
451 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  27.36 
 
 
451 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  27.36 
 
 
451 aa  147  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  27.59 
 
 
451 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  27.59 
 
 
451 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  27.59 
 
 
451 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  27.12 
 
 
452 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.11 
 
 
477 aa  146  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  26.82 
 
 
459 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.4 
 
 
455 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  25.82 
 
 
456 aa  144  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  25.8 
 
 
456 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  26.4 
 
 
449 aa  142  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  24.03 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  27.97 
 
 
459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  24.59 
 
 
448 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  24.49 
 
 
448 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  25.31 
 
 
446 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  27.03 
 
 
443 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  25.29 
 
 
455 aa  137  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  25.5 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.96 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  27.05 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
456 aa  134  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  26.01 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  25.86 
 
 
461 aa  129  8.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  25.52 
 
 
496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  26.21 
 
 
465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  23.03 
 
 
466 aa  127  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  23.97 
 
 
460 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  24 
 
 
442 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  31.53 
 
 
466 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  23.68 
 
 
440 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
444 aa  123  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  24.58 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  24.61 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.33 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.3 
 
 
467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  25.32 
 
 
460 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  23.09 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  22.48 
 
 
446 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  23.65 
 
 
493 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  24.52 
 
 
470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  21.03 
 
 
451 aa  110  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
451 aa  110  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  22.74 
 
 
452 aa  109  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.36 
 
 
434 aa  110  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
440 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  23.65 
 
 
455 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  22.96 
 
 
468 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0874  putative integral membrane protein  27.17 
 
 
439 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.512566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  24.03 
 
 
451 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
445 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  24.78 
 
 
455 aa  103  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>