More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2786 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
411 aa  832  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 
409 aa  302  8e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  39.12 
 
 
409 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  39.12 
 
 
409 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  35.8 
 
 
412 aa  266  3e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 
409 aa  262  8e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 
409 aa  254  2e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 
409 aa  254  2e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  34.9 
 
 
409 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 
408 aa  239  7e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 
408 aa  236  5e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  3.5636e-09 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1633  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 
386 aa  177  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  45.76 
 
 
185 aa  163  5e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0888  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 
369 aa  117  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0171  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 
719 aa  99  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2109  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 
209 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132617  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  23.78 
 
 
427 aa  96.7  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1572  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  29.68 
 
 
387 aa  95.5  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  30.81 
 
 
517 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  6.11836e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.24 
 
 
415 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1537  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 
370 aa  91.3  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  40.14 
 
 
286 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 
548 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  31.03 
 
 
365 aa  84.7  2e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 
291 aa  84.7  3e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  35 
 
 
530 aa  84  4e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 
515 aa  82.4  1e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  28.85 
 
 
310 aa  82  2e-14  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 
513 aa  80.9  4e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
535 aa  80.5  5e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.1 
 
 
292 aa  80.5  5e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  41.41 
 
 
242 aa  80.1  7e-14  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.41 
 
 
292 aa  78.6  2e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  3.16606e-07 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.41 
 
 
309 aa  78.6  2e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.41 
 
 
281 aa  78.6  2e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.41 
 
 
292 aa  78.6  2e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 
292 aa  78.6  2e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.41 
 
 
292 aa  78.6  2e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  32.41 
 
 
292 aa  78.6  2e-13  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.41 
 
 
292 aa  78.6  2e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  30.5 
 
 
538 aa  77.8  3e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 
519 aa  77.8  4e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0644  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
402 aa  77.8  4e-13  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 
440 aa  77  5e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  23.5 
 
 
430 aa  76.6  7e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.21 
 
 
280 aa  76.6  8e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1455  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  36.46 
 
 
391 aa  75.9  1e-12  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  23.28 
 
 
291 aa  76.3  1e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 
519 aa  75.9  1e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  38 
 
 
281 aa  74.7  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  38 
 
 
281 aa  74.7  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  38 
 
 
281 aa  74.7  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1001  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 
307 aa  75.5  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3119  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.07 
 
 
293 aa  75.1  2e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00676861  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  38 
 
 
281 aa  75.1  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  38 
 
 
281 aa  74.7  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  39 
 
 
250 aa  75.1  2e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3756  transcriptional regulator, AraC family  40.66 
 
 
285 aa  75.1  2e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295664  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 
544 aa  74.7  3e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.08 
 
 
310 aa  74.7  3e-12  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  38 
 
 
250 aa  74.3  3e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
300 aa  73.9  4e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.08 
 
 
310 aa  74.3  4e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.35 
 
 
314 aa  73.9  5e-12  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 
294 aa  73.9  5e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
299 aa  73.6  6e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 
308 aa  73.2  7e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.64 
 
 
305 aa  73.2  8e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11757e-05 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
532 aa  72.8  9e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 
531 aa  72.8  1e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
284 aa  72.8  1e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 
502 aa  72.4  1e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  33.57 
 
 
529 aa  72.4  1e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1151  helix-turn-helix domain-containing protein  39.8 
 
 
265 aa  71.6  2e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 
259 aa  71.6  2e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1251  two component transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 
566 aa  72  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 
196 aa  71.6  2e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 
297 aa  71.6  2e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 
272 aa  71.6  2e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.86 
 
 
316 aa  71.6  2e-11  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0432  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 
397 aa  72  2e-11  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2782  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
293 aa  72  2e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0157891 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 
274 aa  71.2  3e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 
522 aa  71.2  3e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 
188 aa  71.2  3e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
356 aa  71.2  3e-11  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  36.08 
 
 
507 aa  71.2  3e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  36.08 
 
 
507 aa  71.2  3e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.43 
 
 
327 aa  71.2  3e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  33.33 
 
 
303 aa  71.2  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  33.33 
 
 
303 aa  71.2  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  33.33 
 
 
303 aa  71.2  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 
773 aa  71.2  3e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  33.33 
 
 
303 aa  71.2  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  33.33 
 
 
303 aa  71.2  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 
233 aa  70.9  4e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 
546 aa  70.9  4e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.65 
 
 
310 aa  70.9  4e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  28.42 
 
 
160 aa  70.9  4e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  32.14 
 
 
529 aa  70.9  4e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>