More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2615 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  92.73 
 
 		 689 aa  1301    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  94.33 
 
 		 689 aa  1331    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  93.75 
 
 		 689 aa  1327    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  94.33 
 
 		 689 aa  1330    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  94.33 
 
 		 689 aa  1331    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  94.07 
 
 		 691 aa  1336    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  100 
 
 		 691 aa  1415    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  94.33 
 
 		 689 aa  1322    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  93.49 
 
 		 691 aa  1332    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  93.9 
 
 		 689 aa  1323    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  42.8 
 
 		 712 aa  561  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  34.54 
 
 		 760 aa  405  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.1 
 
 		 763 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  35.82 
 
 		 763 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  35.11 
 
 		 755 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  33.08 
 
 		 706 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  33.03 
 
 		 706 aa  324  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  34.62 
 
 		 753 aa  323  9.000000000000001e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  30.23 
 
 		 768 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  32.05 
 
 		 702 aa  306  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  30.92 
 
 		 778 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  30 
 
 		 702 aa  298  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  30.87 
 
 		 780 aa  296  7e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  30.36 
 
 		 778 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  30.92 
 
 		 776 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  30.48 
 
 		 776 aa  292  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  30.92 
 
 		 776 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  32.51 
 
 		 703 aa  292  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  31.2 
 
 		 777 aa  291  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  30.69 
 
 		 777 aa  290  8e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  30.13 
 
 		 776 aa  286  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  31.4 
 
 		 748 aa  281  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  28.12 
 
 		 785 aa  273  9e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.26 
 
 		 768 aa  254  5.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  28.89 
 
 		 762 aa  251  4e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  30.06 
 
 		 764 aa  246  9e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  26.84 
 
 		 666 aa  200  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  26.18 
 
 		 717 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.7 
 
 		 706 aa  194  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.76 
 
 		 670 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.31 
 
 		 710 aa  189  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  24.93 
 
 		 692 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.08 
 
 		 672 aa  187  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  27.13 
 
 		 695 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.27 
 
 		 659 aa  184  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  26.37 
 
 		 680 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  40 
 
 		 777 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.58 
 
 		 736 aa  176  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  25.57 
 
 		 727 aa  173  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.59 
 
 		 724 aa  170  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25 
 
 		 645 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  40.38 
 
 		 772 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  34.01 
 
 		 787 aa  164  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  25.4 
 
 		 719 aa  164  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  24.16 
 
 		 852 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  23.41 
 
 		 792 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  23.58 
 
 		 695 aa  155  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  27.06 
 
 		 706 aa  151  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  24.71 
 
 		 1048 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  35.41 
 
 		 269 aa  145  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.78 
 
 		 732 aa  139  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.84 
 
 		 733 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  42.71 
 
 		 813 aa  135  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  35.89 
 
 		 726 aa  135  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.7 
 
 		 861 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  37.32 
 
 		 759 aa  130  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  36.32 
 
 		 758 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  37.63 
 
 		 679 aa  128  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.18 
 
 		 698 aa  128  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  34.93 
 
 		 829 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.17 
 
 		 716 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.5 
 
 		 832 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  34.39 
 
 		 799 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.89 
 
 		 746 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  28.46 
 
 		 724 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  28.19 
 
 		 724 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.06 
 
 		 741 aa  123  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  28.19 
 
 		 724 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  28.29 
 
 		 734 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.69 
 
 		 748 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.78 
 
 		 766 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  36.73 
 
 		 742 aa  122  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.42 
 
 		 757 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  34.91 
 
 		 902 aa  121  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  34.65 
 
 		 759 aa  120  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  37.31 
 
 		 765 aa  119  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.21 
 
 		 693 aa  118  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  34.47 
 
 		 750 aa  117  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  36.68 
 
 		 754 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  34.18 
 
 		 742 aa  117  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  34.54 
 
 		 795 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  36.36 
 
 		 771 aa  116  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0864  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.53 
 
 		 703 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0926772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  35.22 
 
 		 735 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  30.67 
 
 		 684 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  34.84 
 
 		 776 aa  114  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.69 
 
 		 685 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  21.4 
 
 		 715 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.33 
 
 		 767 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.52 
 
 		 758 aa  112  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>