102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2407 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
177 aa  368  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  35.57 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
214 aa  94.7  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
182 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
185 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
180 aa  89.4  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
224 aa  89  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  30.2 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  6.20531e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  30.54 
 
 
207 aa  84.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
179 aa  82.4  3e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 
188 aa  82  4e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  31.79 
 
 
205 aa  79  3e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.84066e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  26.01 
 
 
189 aa  78.2  6e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
206 aa  77.4  9e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
187 aa  77  1e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
215 aa  75.9  3e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
188 aa  75.1  4e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
197 aa  75.1  4e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
207 aa  75.1  5e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
207 aa  75.1  5e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 
209 aa  74.7  6e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  31.37 
 
 
202 aa  74.3  7e-13  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
202 aa  73.9  1e-12  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
209 aa  73.2  2e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
186 aa  72.8  2e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
194 aa  73.6  2e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
231 aa  73.2  2e-12  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 
217 aa  72.8  3e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 
217 aa  72.8  3e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 
199 aa  72.4  3e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  24.73 
 
 
212 aa  72.4  4e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 
184 aa  71.2  7e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
238 aa  69.7  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  26.74 
 
 
238 aa  69.7  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  26.74 
 
 
238 aa  69.7  2e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  26.74 
 
 
238 aa  69.7  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
238 aa  69.7  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
238 aa  69.7  2e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 
209 aa  68.9  3e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  28.08 
 
 
208 aa  68.6  4e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
187 aa  66.2  2e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
180 aa  65.9  3e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 
210 aa  62.8  2e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
209 aa  62.8  3e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 
204 aa  61.6  6e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
205 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
205 aa  59.3  3e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
205 aa  59.3  3e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
207 aa  58.2  6e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 
184 aa  57.8  8e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
207 aa  57.4  9e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 
187 aa  55.5  4e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  21.05 
 
 
191 aa  52  4e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 
202 aa  52  5e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 
177 aa  50.8  1e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00322286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
187 aa  50.4  1e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
188 aa  50.4  1e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 
188 aa  50.4  1e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
193 aa  48.5  4e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 
211 aa  48.1  6e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
219 aa  48.1  6e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 
211 aa  48.1  6e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  27.91 
 
 
219 aa  48.1  6e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 
211 aa  48.1  6e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  28.57 
 
 
195 aa  47.8  9e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 
227 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
215 aa  44.7  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
238 aa  44.3  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  20.26 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  23.08 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  36.54 
 
 
222 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0944  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
123 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.335834  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  40 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
210 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
196 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  30.16 
 
 
199 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
196 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47212e-06 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
200 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
214 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
193 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 
212 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
221 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
204 aa  41.6  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
214 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
202 aa  41.2  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 
307 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
209 aa  41.2  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 
177 aa  41.2  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
212 aa  40.8  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>