More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2313 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  100 
 
 
228 aa  461  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  92.98 
 
 
228 aa  434  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  68.44 
 
 
229 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  62.95 
 
 
233 aa  299  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  62.95 
 
 
233 aa  299  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  62.95 
 
 
233 aa  299  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  62.5 
 
 
233 aa  299  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  62.5 
 
 
233 aa  299  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  62.5 
 
 
233 aa  299  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  62.5 
 
 
233 aa  298  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  62.05 
 
 
233 aa  296  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  61.61 
 
 
233 aa  295  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  61.61 
 
 
233 aa  295  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  57.71 
 
 
246 aa  285  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  59.56 
 
 
234 aa  285  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  58.93 
 
 
233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  59.82 
 
 
233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  59.56 
 
 
234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  57.02 
 
 
225 aa  262  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  56.33 
 
 
234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  55.8 
 
 
232 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  55.36 
 
 
232 aa  257  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.25 
 
 
228 aa  255  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.8 
 
 
228 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.86 
 
 
234 aa  240  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 
231 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  51.12 
 
 
232 aa  232  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.26 
 
 
232 aa  232  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  51.12 
 
 
232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  51.12 
 
 
232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  51.12 
 
 
232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  51.57 
 
 
232 aa  232  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  52.02 
 
 
232 aa  231  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 
232 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  51.57 
 
 
232 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  51.12 
 
 
232 aa  230  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  51.12 
 
 
232 aa  230  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  51.09 
 
 
231 aa  228  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  51.1 
 
 
234 aa  228  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  51.98 
 
 
234 aa  228  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  51.09 
 
 
231 aa  227  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  51.09 
 
 
231 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 
231 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 
231 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 
231 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 
231 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  48.9 
 
 
232 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  51.53 
 
 
231 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 
237 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  51.53 
 
 
231 aa  225  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  48.7 
 
 
232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  48.7 
 
 
232 aa  224  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  48.7 
 
 
232 aa  224  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  48.46 
 
 
232 aa  224  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  48.26 
 
 
232 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 
232 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  47.83 
 
 
232 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  48.26 
 
 
232 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  51.3 
 
 
232 aa  222  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 
236 aa  218  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  47.79 
 
 
237 aa  218  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  47.79 
 
 
237 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  47.35 
 
 
237 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 
230 aa  215  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 
237 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 
237 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 
237 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 
237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  46.02 
 
 
237 aa  210  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
230 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  45.18 
 
 
230 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 
230 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  45.61 
 
 
230 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
230 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
230 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 
230 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
230 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 
230 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 
238 aa  208  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 
230 aa  207  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 
231 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  45.61 
 
 
230 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 
229 aa  206  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 
233 aa  206  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 
232 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1833  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.47 
 
 
227 aa  205  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 
229 aa  205  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  48.02 
 
 
228 aa  204  7e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 
229 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 
230 aa  201  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 
230 aa  201  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 
233 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1218  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0119  DNA-binding response regulator  46.49 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 
228 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 
234 aa  194  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>