More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1928 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  92.82 
 
 
181 aa  341  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
190 aa  121  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
212 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
212 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
212 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
212 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
212 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
212 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  40.8 
 
 
172 aa  89  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 
175 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  36.65 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  24.18 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  25.77 
 
 
159 aa  58.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  29.17 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
142 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
153 aa  56.2  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
178 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
172 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
171 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
142 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  31.2 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  30.15 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  30.38 
 
 
170 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
198 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  22.75 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 
144 aa  52.4  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  24.79 
 
 
178 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  29.2 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
175 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
173 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  28.47 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 
170 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
142 aa  52  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
154 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
168 aa  51.6  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 
153 aa  51.2  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
212 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 
152 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
157 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  27.85 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  27.85 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 
142 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  27.85 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  27.85 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  27.85 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  27.85 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  27.27 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  27.85 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  28.48 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  27.85 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  26.63 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  26.63 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  26.63 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  26.63 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
157 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  26.63 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  37.68 
 
 
138 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  29.17 
 
 
151 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
139 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  26.97 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  29.22 
 
 
151 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  32.26 
 
 
190 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  32.26 
 
 
190 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>