More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1824 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  100 
 
 
225 aa  456  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  93.78 
 
 
225 aa  435  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  92.89 
 
 
254 aa  433  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  93.33 
 
 
225 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  91.56 
 
 
225 aa  431  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  92.89 
 
 
254 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  91.56 
 
 
254 aa  427  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  91.56 
 
 
254 aa  428  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  91.56 
 
 
228 aa  427  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  90.67 
 
 
225 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.96 
 
 
224 aa  312  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.54 
 
 
225 aa  275  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  57.4 
 
 
224 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.82 
 
 
224 aa  259  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2977  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 
223 aa  250  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2001  DNA-binding response regulator  54.55 
 
 
225 aa  250  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3028  DNA-binding response regulator  54.09 
 
 
225 aa  247  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3258  DNA-binding response regulator  54.09 
 
 
225 aa  247  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3261  DNA-binding response regulator  54.09 
 
 
225 aa  247  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3013  response regulator  54.09 
 
 
225 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3272  DNA-binding response regulator  54.34 
 
 
225 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0802882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3279  DNA-binding response regulator  54.34 
 
 
225 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2949  response regulator  53.64 
 
 
225 aa  246  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.028063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3249  DNA-binding response regulator  54.09 
 
 
225 aa  246  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1953  DNA-binding response regulator  47.93 
 
 
224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2385  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 
224 aa  218  8.999999999999998e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2431  response regulator receiver  45.21 
 
 
224 aa  218  8.999999999999998e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.721266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 
228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 
228 aa  214  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 
223 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 
237 aa  208  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 
236 aa  205  6e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 
223 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 
223 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 
223 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  43.89 
 
 
223 aa  201  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 
223 aa  201  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 
223 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 
223 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 
227 aa  201  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  43.44 
 
 
223 aa  201  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  43.44 
 
 
223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  43.44 
 
 
223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 
233 aa  198  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 
230 aa  194  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 
229 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 
229 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 
225 aa  191  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 
232 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  42.06 
 
 
241 aa  188  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
231 aa  185  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 
227 aa  185  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
231 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  42.92 
 
 
241 aa  184  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 
221 aa  184  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 
241 aa  184  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 
221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  41.99 
 
 
231 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.55 
 
 
230 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 
235 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 
230 aa  181  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  41.13 
 
 
231 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  41.13 
 
 
231 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  41.13 
 
 
231 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  41.13 
 
 
231 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  41.13 
 
 
231 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 
231 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 
236 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 
230 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 
231 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  40.69 
 
 
231 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 
226 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 
228 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 
234 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 
232 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  41.59 
 
 
226 aa  179  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  41.38 
 
 
234 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 
234 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 
235 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 
240 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  41.92 
 
 
239 aa  177  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 
225 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 
229 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  42.11 
 
 
235 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 
223 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
235 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0544  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 
227 aa  176  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  41.92 
 
 
228 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 
232 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 
237 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 
233 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
235 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 
225 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>