More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1584 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
261 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  95.79 
 
 
261 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  95.79 
 
 
261 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  95.4 
 
 
261 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  95.02 
 
 
261 aa  502  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  94.64 
 
 
261 aa  497  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  94.64 
 
 
261 aa  497  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  93.87 
 
 
261 aa  498  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  92.34 
 
 
259 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  91.95 
 
 
261 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  72.41 
 
 
238 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  51.24 
 
 
196 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  38.49 
 
 
228 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  52 
 
 
191 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  47.86 
 
 
206 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  50.42 
 
 
217 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  48.36 
 
 
261 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  50.43 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  50 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  42.68 
 
 
234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  46.61 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  44.92 
 
 
217 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  49.14 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  49.14 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  49.14 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  49.18 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  46.51 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  45.16 
 
 
206 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  47.41 
 
 
245 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  47.33 
 
 
226 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 
251 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  44.6 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  44.09 
 
 
212 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  49.59 
 
 
174 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  43.41 
 
 
189 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  48.28 
 
 
217 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  40.94 
 
 
199 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  44.53 
 
 
328 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  47.46 
 
 
438 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  44.92 
 
 
216 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  45.16 
 
 
204 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  45.53 
 
 
195 aa  122  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  33.81 
 
 
237 aa  121  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  44.92 
 
 
202 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  45.22 
 
 
188 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  45.16 
 
 
204 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  45.74 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  44.17 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  44.17 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  45.53 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  45.6 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  45.16 
 
 
198 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  40.58 
 
 
199 aa  119  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  37.42 
 
 
197 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  48.21 
 
 
370 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  44.96 
 
 
281 aa  116  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  41.54 
 
 
283 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  36.14 
 
 
211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 
318 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 
260 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  46.02 
 
 
362 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  36.91 
 
 
208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  47.79 
 
 
362 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 
304 aa  115  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  43.97 
 
 
244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  44.17 
 
 
146 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  41.74 
 
 
442 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  45.83 
 
 
196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  45.08 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  46.02 
 
 
200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  51.72 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  44.83 
 
 
326 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 
291 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  42.74 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  49.14 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  41.88 
 
 
273 aa  112  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  39.84 
 
 
203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  43.31 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  42.52 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  42.52 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  47.01 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  42.15 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  45.76 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  37.23 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  41.03 
 
 
197 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  41.6 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  43.8 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  40.17 
 
 
224 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 
218 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  44.25 
 
 
354 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  39.68 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  36.23 
 
 
202 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  43.93 
 
 
258 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  44.04 
 
 
329 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>