39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1409 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1409  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 159 aa  317  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000791474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3803  lysM domain protein  87.42 
 
 		 159 aa  258  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  hitchhiker  1.81276e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1542  lysM domain protein  87.42 
 
 		 159 aa  256  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1612  lysM domain-containing protein  86.79 
 
 		 159 aa  256  8e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000378837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1648  lysM domain protein  86.79 
 
 		 159 aa  256  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000383151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1368  peptidoglycan-binding protein  87.42 
 
 		 159 aa  254  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1507  lysm domain-containing protein  86.79 
 
 		 159 aa  253  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000123436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1396  lysM domain-containing protein  86.79 
 
 		 159 aa  253  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000873032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1369  peptidoglycan-binding protein  88.68 
 
 		 162 aa  242  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.6403400000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1581  lysM domain protein  88.68 
 
 		 159 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05729e-36 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1210  peptidoglycan-binding LysM  59.88 
 
 		 160 aa  170  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000146268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2191  Peptidoglycan-binding LysM  31.25 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0438  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.28 
 
 		 180 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0569  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.94 
 
 		 471 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  34.38 
 
 		 471 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  40.32 
 
 		 849 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1716  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 597 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.925679  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  37.29 
 
 		 447 aa  45.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  33.9 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3975  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 		 430 aa  43.9  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  33.87 
 
 		 474 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65370  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.65 
 
 		 475 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0750  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 377 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000075939  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.3 
 
 		 334 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.71 
 
 		 475 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0157  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.79 
 
 		 353 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.31 
 
 		 840 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0632  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.3 
 
 		 471 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.419176 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  50 
 
 		 583 aa  42  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  35.85 
 
 		 516 aa  41.6  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4688  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.84 
 
 		 477 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2542  peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 		 116 aa  41.2  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0261672  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.43 
 
 		 554 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  48.89 
 
 		 451 aa  40.8  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0894  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.73 
 
 		 472 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3314  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.48 
 
 		 447 aa  40.8  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000664916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2095  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34 
 
 		 335 aa  40.8  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.3 
 
 		 440 aa  40.8  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 289 aa  40.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>