More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1337 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1337  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  100 
 
 
323 aa  653  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1535  glycerate dehydrogenase  95.67 
 
 
323 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1298  glycerate dehydrogenase  95.36 
 
 
323 aa  595  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.952061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1325  glycerate dehydrogenase  95.36 
 
 
323 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1299  glycerate dehydrogenase  95.67 
 
 
323 aa  596  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1434  glycerate dehydrogenase  95.36 
 
 
323 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1506  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  95.05 
 
 
339 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0180022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1468  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  95.36 
 
 
323 aa  587  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3876  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  95.67 
 
 
323 aa  590  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1574  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  94.74 
 
 
323 aa  587  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1137  glycerate dehydrogenase  87.31 
 
 
323 aa  545  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.657649  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2957  Glyoxylate reductase  61.95 
 
 
320 aa  416  1e-115  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  8.53458e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2371  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  66.25 
 
 
317 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.421154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2328  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  66.25 
 
 
317 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1888  glycerate dehydrogenase  64.98 
 
 
317 aa  394  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  55.31 
 
 
338 aa  355  6e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.16966e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  46.71 
 
 
319 aa  319  4e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.09 
 
 
320 aa  307  1e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  46.71 
 
 
319 aa  304  1e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  50.79 
 
 
316 aa  298  8e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.84 
 
 
327 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.84 
 
 
323 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  45.98 
 
 
317 aa  289  5e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  50 
 
 
323 aa  283  2e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  47.8 
 
 
315 aa  283  2e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  46.54 
 
 
327 aa  278  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  46.75 
 
 
339 aa  276  5e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.77 
 
 
318 aa  274  1e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  49.82 
 
 
274 aa  272  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  44.48 
 
 
324 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  44.51 
 
 
327 aa  270  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.16 
 
 
329 aa  270  3e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.89 
 
 
326 aa  268  9e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  43.89 
 
 
319 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2029  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.14 
 
 
331 aa  266  5e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.658247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  43.23 
 
 
322 aa  265  6e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  43.23 
 
 
322 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  44.83 
 
 
322 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  46.84 
 
 
321 aa  256  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.9 
 
 
326 aa  254  2e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  44.26 
 
 
332 aa  253  4e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.08 
 
 
335 aa  252  5e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  40.63 
 
 
328 aa  252  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.69 
 
 
319 aa  249  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.69 
 
 
319 aa  249  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  40.43 
 
 
334 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.66306e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1774  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.27 
 
 
328 aa  246  5e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1989  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.25 
 
 
332 aa  244  1e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.14509e-07 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  39.38 
 
 
341 aa  244  2e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2490  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.67 
 
 
326 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.0359578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.67 
 
 
326 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  42.81 
 
 
322 aa  243  4e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  40.19 
 
 
340 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5009  Glyoxylate reductase  46.86 
 
 
345 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.92 
 
 
332 aa  239  3e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1806  glyoxylate reductase, NADH-dependent  42.9 
 
 
318 aa  239  3e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.276672  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  39.62 
 
 
328 aa  239  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0811  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.1 
 
 
329 aa  239  6e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868894  normal  0.495014 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2082  putative glyoxylate reductase  48.22 
 
 
311 aa  238  8e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2232  glyoxylate reductase  38.61 
 
 
334 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770624  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_004310  BR2177  2-hydroxyacid dehydrogenase  41.28 
 
 
334 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  39.3 
 
 
328 aa  236  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.97 
 
 
334 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.85 
 
 
329 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501657  normal  0.548764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  40.62 
 
 
333 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  41.41 
 
 
330 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.07425e-10 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2144  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.56 
 
 
327 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126393  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  42.27 
 
 
318 aa  236  5e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2069  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.14 
 
 
338 aa  236  5e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  hitchhiker  0.00440451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1055  putative 2-ketogluconate reductase  40.55 
 
 
329 aa  236  5e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453288  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.74 
 
 
338 aa  235  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2171  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  42.95 
 
 
319 aa  235  7e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0516  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  40.43 
 
 
323 aa  235  8e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.67 
 
 
328 aa  234  1e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.295585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0734  glyoxylate reductase  42.05 
 
 
334 aa  234  2e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0491  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.66 
 
 
334 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.159466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4409  Glyoxylate reductase  40.62 
 
 
333 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  40.25 
 
 
348 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0354  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.44 
 
 
333 aa  233  4e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2089  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  41.08 
 
 
360 aa  233  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0915  glycolate reductase  38.66 
 
 
328 aa  232  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0045  glycolate reductase  39.94 
 
 
333 aa  232  8e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0421  glyoxylate reductase  37.34 
 
 
334 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1622  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.67 
 
 
328 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1511  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  40.3 
 
 
330 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1700  glyoxylate reductase  40.37 
 
 
329 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142261  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  39.75 
 
 
357 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0454  Glyoxylate reductase  37.34 
 
 
334 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0616  glycolate reductase  39.62 
 
 
333 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.164009  normal  0.739165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  38.68 
 
 
334 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3790  glycolate reductase  37.82 
 
 
328 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  39.51 
 
 
331 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2187  glyoxylate reductase  40.71 
 
 
328 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521168  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01500  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  39.51 
 
 
329 aa  229  7e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2926  2-hydroxyacid dehydrogenase  40.06 
 
 
329 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0936  2-hydroxyacid dehydrogenase  44.61 
 
 
326 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2870  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  40.06 
 
 
352 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156686  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2485  Glyoxylate reductase  38.8 
 
 
331 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0987  glyoxylate reductase  40.71 
 
 
328 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2313  2-hydroxyacid dehydrogenase  40.71 
 
 
328 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>