70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1242 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
394 aa  820    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  92.13 
 
 
394 aa  764    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  91.12 
 
 
394 aa  756    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  90.61 
 
 
394 aa  753    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  90.61 
 
 
394 aa  753    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  90.1 
 
 
394 aa  747    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  91.37 
 
 
394 aa  757    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  89.59 
 
 
394 aa  748    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  90.61 
 
 
394 aa  753    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  90.61 
 
 
394 aa  753    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  26.65 
 
 
398 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  26.55 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  24.34 
 
 
384 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  23.04 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  24.32 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  20.78 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  20.65 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  22.89 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  22.47 
 
 
378 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  24.37 
 
 
403 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  19.51 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  22.22 
 
 
403 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  23.36 
 
 
401 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  22.41 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  23.49 
 
 
405 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  23.06 
 
 
401 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
401 aa  57  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  23.34 
 
 
404 aa  57.4  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  22.07 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  23.21 
 
 
401 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  20.87 
 
 
401 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  23.86 
 
 
401 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  24.38 
 
 
399 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  20.32 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  22.26 
 
 
398 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  22.15 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  20.75 
 
 
392 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  23.81 
 
 
376 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  19.79 
 
 
399 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  25.56 
 
 
373 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  21.91 
 
 
398 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  23.74 
 
 
401 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  23.24 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  25.58 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  21.55 
 
 
397 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  22.66 
 
 
394 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  23.37 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  22.3 
 
 
399 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  24.12 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  21.28 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  22.78 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  20.49 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  21.79 
 
 
407 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  23.22 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  22.46 
 
 
400 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  22.22 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  23.49 
 
 
398 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  24.42 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  22.07 
 
 
400 aa  47  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  21.34 
 
 
347 aa  47  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  23.61 
 
 
348 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  21.28 
 
 
414 aa  47  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  19.77 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  20.61 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  21.9 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  22.71 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  22.17 
 
 
407 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  22.17 
 
 
407 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  22.17 
 
 
407 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  24.14 
 
 
351 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>