More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1094 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  95.04 
 
 		 464 aa  875    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  95.47 
 
 		 464 aa  877    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  95.47 
 
 		 464 aa  877    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  95.04 
 
 		 464 aa  872    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  100 
 
 		 464 aa  932    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  95.47 
 
 		 464 aa  877    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  94.37 
 
 		 463 aa  871    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  95.04 
 
 		 464 aa  874    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  93.75 
 
 		 464 aa  867    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  94.83 
 
 		 464 aa  869    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  88.55 
 
 		 463 aa  827    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  45.41 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  43.48 
 
 		 450 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  41.19 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  38.64 
 
 		 442 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  37.19 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  35.78 
 
 		 464 aa  294  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  35.39 
 
 		 439 aa  274  3e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  35.51 
 
 		 446 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  34.02 
 
 		 439 aa  264  3e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  35.29 
 
 		 486 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  32.57 
 
 		 440 aa  260  5.0000000000000005e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 453 aa  259  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  32.57 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  35.15 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  34.42 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  34.42 
 
 		 456 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  34.88 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  33.63 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  34.92 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  34.92 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  34.92 
 
 		 476 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 438 aa  219  6e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.48 
 
 		 555 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  30.61 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 475 aa  173  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  28.7 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  30.8 
 
 		 445 aa  169  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 450 aa  154  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  28.12 
 
 		 458 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  27.63 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  27.78 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 468 aa  140  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.26 
 
 		 450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 438 aa  136  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 461 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  27.73 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 459 aa  133  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 445 aa  132  9e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25 
 
 		 452 aa  133  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  24.5 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  22.3 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  25.81 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  24.5 
 
 		 484 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  24.5 
 
 		 546 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  22.52 
 
 		 459 aa  130  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  24.5 
 
 		 547 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 495 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  24.5 
 
 		 547 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 445 aa  129  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  24.49 
 
 		 495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 450 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  24.5 
 
 		 546 aa  128  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  28.31 
 
 		 474 aa  126  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  25.49 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  28.53 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  27.6 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 458 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.7 
 
 		 460 aa  119  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  25.17 
 
 		 474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  25.17 
 
 		 474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  25.11 
 
 		 502 aa  117  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 462 aa  117  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  23.15 
 
 		 454 aa  116  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>