More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0798 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  100 
 
 
400 aa  827    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  63.96 
 
 
404 aa  544  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  62.53 
 
 
402 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  62.03 
 
 
402 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  61.99 
 
 
407 aa  527  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  58.78 
 
 
404 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  51.41 
 
 
409 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  49.11 
 
 
400 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  50.89 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  48.72 
 
 
394 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.76 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  47.31 
 
 
397 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  48.98 
 
 
397 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  49.61 
 
 
398 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  46.94 
 
 
398 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  47.57 
 
 
409 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  47.96 
 
 
398 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  46.17 
 
 
403 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  48.91 
 
 
396 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.88 
 
 
390 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  47.24 
 
 
422 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.582782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  46.98 
 
 
422 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  46.98 
 
 
422 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  46.29 
 
 
410 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  46.73 
 
 
422 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  46.73 
 
 
422 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  46.98 
 
 
422 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  46.98 
 
 
422 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  46.98 
 
 
422 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  46.98 
 
 
422 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  44.62 
 
 
396 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  46.29 
 
 
410 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  47.12 
 
 
416 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  44.92 
 
 
399 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  43.07 
 
 
407 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  46.87 
 
 
416 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  44.08 
 
 
403 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  47.58 
 
 
422 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  47.84 
 
 
422 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  47.84 
 
 
422 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  46.62 
 
 
416 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  47.58 
 
 
422 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  47.58 
 
 
422 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  46.43 
 
 
425 aa  362  6e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  43.33 
 
 
396 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  44.22 
 
 
400 aa  361  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  43.33 
 
 
406 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  45.41 
 
 
410 aa  359  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  43.69 
 
 
416 aa  359  5e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  44.67 
 
 
408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  44.21 
 
 
395 aa  356  5e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  42.45 
 
 
625 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  39.47 
 
 
398 aa  333  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  43.15 
 
 
396 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  39.71 
 
 
427 aa  330  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  40.43 
 
 
427 aa  325  7e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 
401 aa  325  9e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 
396 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  40.92 
 
 
408 aa  324  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  40.92 
 
 
412 aa  323  3e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 
400 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  41.58 
 
 
406 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 
403 aa  312  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  40.31 
 
 
403 aa  312  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  38.06 
 
 
442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  42.45 
 
 
400 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 
399 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  38.48 
 
 
402 aa  276  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  47.08 
 
 
245 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  34.5 
 
 
409 aa  210  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
408 aa  210  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
405 aa  209  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 
406 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 
399 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  30.53 
 
 
403 aa  203  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 
399 aa  203  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
405 aa  186  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 
437 aa  169  7e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
364 aa  149  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
369 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 
375 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  27.98 
 
 
383 aa  139  7e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 
479 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  25 
 
 
373 aa  138  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  26.39 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
478 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  29.22 
 
 
373 aa  133  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
368 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  30.69 
 
 
489 aa  130  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
496 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
374 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 
371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  26.38 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  26.38 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  26.38 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  26.38 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  26.38 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  26.38 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>