More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0528 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  100 
 
 
449 aa  896    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  98 
 
 
449 aa  852    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  82.72 
 
 
461 aa  733    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  97.47 
 
 
395 aa  746    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  80.99 
 
 
452 aa  695    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  97.77 
 
 
449 aa  850    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  97.77 
 
 
449 aa  850    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  82.29 
 
 
461 aa  753    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  82.07 
 
 
461 aa  729    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  80.99 
 
 
452 aa  695    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  81.86 
 
 
463 aa  743    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  65.87 
 
 
461 aa  593  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  65.44 
 
 
461 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  65.44 
 
 
461 aa  588  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  65.44 
 
 
461 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  65.44 
 
 
461 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  65.44 
 
 
461 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  65.01 
 
 
461 aa  585  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  65.01 
 
 
461 aa  586  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  65.23 
 
 
461 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  64.79 
 
 
461 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  65.31 
 
 
464 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  57.02 
 
 
463 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  57.05 
 
 
463 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  52.05 
 
 
467 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  46.09 
 
 
462 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  45.64 
 
 
462 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  44.9 
 
 
451 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  46.07 
 
 
479 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  44.74 
 
 
490 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  44.32 
 
 
491 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  43.64 
 
 
490 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  42.83 
 
 
489 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  43.64 
 
 
489 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  43.64 
 
 
489 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  43.86 
 
 
489 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  43.04 
 
 
501 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  42.4 
 
 
501 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  42.4 
 
 
501 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  42.4 
 
 
501 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  42.74 
 
 
489 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  41.63 
 
 
500 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  42.4 
 
 
501 aa  354  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  43.64 
 
 
444 aa  343  5e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  39.36 
 
 
446 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  39.36 
 
 
446 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  40.18 
 
 
432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  43.89 
 
 
436 aa  303  5.000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  41.11 
 
 
504 aa  300  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  35.52 
 
 
497 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  35.38 
 
 
501 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  36.1 
 
 
495 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  36.29 
 
 
477 aa  274  3e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  35.81 
 
 
527 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  46.62 
 
 
324 aa  273  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  35.44 
 
 
471 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  33.47 
 
 
497 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  33.61 
 
 
497 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  33.4 
 
 
495 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  31.65 
 
 
499 aa  256  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  37.64 
 
 
483 aa  256  7e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  32.93 
 
 
507 aa  256  7e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  33.2 
 
 
498 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  36.91 
 
 
510 aa  249  6e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  36.69 
 
 
510 aa  247  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 
516 aa  244  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  34.18 
 
 
544 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  31.26 
 
 
496 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  32.51 
 
 
501 aa  240  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  32.51 
 
 
501 aa  240  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  32.46 
 
 
517 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  35.89 
 
 
499 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  33.66 
 
 
544 aa  237  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  31.22 
 
 
490 aa  236  4e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  30.28 
 
 
499 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  32.41 
 
 
501 aa  234  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  36.2 
 
 
502 aa  234  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  33.47 
 
 
520 aa  232  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  31.45 
 
 
524 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  31.16 
 
 
517 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  32.57 
 
 
483 aa  227  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  33.06 
 
 
558 aa  226  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  32.05 
 
 
512 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  32.05 
 
 
512 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  30.31 
 
 
509 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  33.67 
 
 
492 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  33.67 
 
 
492 aa  223  7e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  31.9 
 
 
497 aa  216  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  31.87 
 
 
511 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  32.85 
 
 
493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  32.85 
 
 
493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  32.85 
 
 
493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  32.85 
 
 
493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  31.01 
 
 
517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  32.85 
 
 
493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  29.64 
 
 
566 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4613  amino acid/peptide transporter  30.43 
 
 
445 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  29.27 
 
 
482 aa  210  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  33.8 
 
 
533 aa  209  7e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  30.62 
 
 
516 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>