More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0176 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  624  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  94.98 
 
 
299 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  94.65 
 
 
299 aa  600  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  94.65 
 
 
299 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  94.65 
 
 
299 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  94.65 
 
 
299 aa  600  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  94.31 
 
 
299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0211  AraC family transcriptional regulator  88.46 
 
 
90 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2244  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.7 
 
 
499 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  48.57 
 
 
300 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  48.57 
 
 
300 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
300 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  48.57 
 
 
300 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  48.57 
 
 
300 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
300 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
300 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  47.62 
 
 
300 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
300 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  47.62 
 
 
300 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  43.27 
 
 
129 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  42.57 
 
 
113 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  42.57 
 
 
113 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 
113 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  42.57 
 
 
113 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  42.57 
 
 
113 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  42.57 
 
 
113 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 
152 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  40.5 
 
 
285 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1051  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 
276 aa  92.4  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 
293 aa  92.4  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  43.14 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
136 aa  90.5  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
281 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0557  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
289 aa  89.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3609  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  39.5 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  30.6 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0814  right origin-binding protein  40 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 
280 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3481  right origin-binding protein  40 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  30.6 
 
 
281 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  43.27 
 
 
288 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  34.92 
 
 
308 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 
277 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  39.22 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 
315 aa  86.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 
306 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0709  hypothetical protein  29.94 
 
 
229 aa  85.9  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04272  DNA-binding transcriptional activator  39 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3601  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4837  right origin-binding protein  39 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5910  right origin-binding protein  39 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04237  hypothetical protein  39 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4910  right origin-binding protein  39 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4994  right origin-binding protein  39 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4632  right origin-binding protein  39 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4946  right origin-binding protein  39 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4998  right origin-binding protein  39 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4996  right origin-binding protein  39 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3660  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4943  right origin-binding protein  39 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4944  right origin-binding protein  39 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3144  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 
243 aa  85.5  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  36.45 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0266  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  37.25 
 
 
108 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  38.83 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 
452 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  38.38 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  35.09 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  37.37 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  39.39 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  39.81 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>