More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0077 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  100 
 
 
458 aa  934  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  98.25 
 
 
458 aa  922  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  98.47 
 
 
458 aa  924  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  98.47 
 
 
458 aa  924  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  98.25 
 
 
458 aa  922  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  98.69 
 
 
458 aa  925  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  71.93 
 
 
484 aa  681  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  95.41 
 
 
458 aa  899  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  98.25 
 
 
458 aa  922  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  98.25 
 
 
458 aa  922  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  98.47 
 
 
458 aa  922  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  98.03 
 
 
458 aa  922  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  74.12 
 
 
457 aa  692  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  63.89 
 
 
457 aa  615  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  64.69 
 
 
457 aa  608  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  64.25 
 
 
454 aa  601  1e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  64.25 
 
 
454 aa  601  1e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  64.02 
 
 
454 aa  598  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  63.24 
 
 
453 aa  582  1e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  58.7 
 
 
470 aa  569  1e-161  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  65.01 
 
 
415 aa  546  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  57.08 
 
 
459 aa  540  1e-152  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02144e-10 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  63.25 
 
 
408 aa  532  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  57.83 
 
 
454 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  56.14 
 
 
453 aa  525  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  56.44 
 
 
453 aa  521  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.66532e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  58.09 
 
 
460 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85269e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  55.56 
 
 
450 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  58.09 
 
 
449 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  55.7 
 
 
449 aa  510  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  55.56 
 
 
449 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  55.07 
 
 
452 aa  502  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  56.7 
 
 
450 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.97198e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  56.17 
 
 
448 aa  501  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  54.73 
 
 
448 aa  495  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  53.49 
 
 
457 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  55.82 
 
 
462 aa  491  1e-138  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  53.95 
 
 
489 aa  494  1e-138  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  53.68 
 
 
476 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  52.95 
 
 
457 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  52.64 
 
 
465 aa  482  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  56.73 
 
 
462 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  54.34 
 
 
445 aa  480  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  54.1 
 
 
457 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  50 
 
 
507 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  52.55 
 
 
455 aa  473  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  49.39 
 
 
520 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  53.41 
 
 
446 aa  470  1e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  56.48 
 
 
462 aa  469  1e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  51.97 
 
 
453 aa  471  1e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  48.88 
 
 
514 aa  469  1e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  48.88 
 
 
514 aa  469  1e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 
451 aa  467  1e-130  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.21912e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  49.17 
 
 
517 aa  466  1e-130  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  48.26 
 
 
458 aa  465  1e-130  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  51.85 
 
 
461 aa  467  1e-130  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  52.63 
 
 
452 aa  466  1e-130  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  48.41 
 
 
518 aa  463  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  57.14 
 
 
471 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  52.31 
 
 
453 aa  460  1e-128  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  51.74 
 
 
462 aa  458  1e-128  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 
453 aa  455  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  50.77 
 
 
457 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 
453 aa  454  1e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 
464 aa  453  1e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  51.13 
 
 
452 aa  454  1e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  50.93 
 
 
453 aa  451  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  51.95 
 
 
465 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 
462 aa  450  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  50.46 
 
 
462 aa  445  1e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  53.44 
 
 
460 aa  447  1e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  49.77 
 
 
453 aa  446  1e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0571  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 
494 aa  444  1e-123  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3182  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 
465 aa  442  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.540345 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  51.99 
 
 
455 aa  439  1e-122  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  49.42 
 
 
454 aa  440  1e-122  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  52.2 
 
 
452 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  52.08 
 
 
458 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  2.51063e-05 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  49.01 
 
 
451 aa  435  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.55938e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  50.47 
 
 
461 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  51.64 
 
 
458 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  52.2 
 
 
452 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  51.55 
 
 
456 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  49.01 
 
 
451 aa  435  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  49.37 
 
 
478 aa  438  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  52.8 
 
 
464 aa  435  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  47.91 
 
 
461 aa  433  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  51.33 
 
 
456 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  48.88 
 
 
447 aa  434  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  48.83 
 
 
448 aa  431  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  49.32 
 
 
463 aa  432  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 
451 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  47.78 
 
 
451 aa  433  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.62714e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2383  DNA repair protein RadA  52.27 
 
 
465 aa  430  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  52.21 
 
 
456 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  51.51 
 
 
467 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 
456 aa  430  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  47.73 
 
 
464 aa  428  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  50.98 
 
 
458 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  51.26 
 
 
463 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>