More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3772 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 505 aa  1008    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  87.7 
 
 		 504 aa  904    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  88.91 
 
 		 505 aa  915    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  89.11 
 
 		 505 aa  918    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  88.71 
 
 		 505 aa  914    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  89.11 
 
 		 505 aa  918    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  89.11 
 
 		 505 aa  918    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  88.71 
 
 		 505 aa  914    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  88.49 
 
 		 504 aa  909    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  88.91 
 
 		 505 aa  917    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  88.1 
 
 		 504 aa  912    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  63.33 
 
 		 498 aa  628  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  60.59 
 
 		 503 aa  618  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  57.11 
 
 		 516 aa  579  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  56.92 
 
 		 532 aa  571  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  56.32 
 
 		 516 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  55.93 
 
 		 516 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  55.73 
 
 		 516 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  55.73 
 
 		 516 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  55.73 
 
 		 516 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  55.53 
 
 		 516 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  55.73 
 
 		 516 aa  561  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  55.53 
 
 		 516 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  55.53 
 
 		 516 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  51.72 
 
 		 523 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  48.02 
 
 		 506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  48.29 
 
 		 490 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  47.06 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  48.2 
 
 		 546 aa  445  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  47.23 
 
 		 548 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  47.23 
 
 		 548 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  47.96 
 
 		 659 aa  438  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  48.48 
 
 		 659 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  44.56 
 
 		 577 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  44.53 
 
 		 531 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  45.69 
 
 		 544 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  44.22 
 
 		 600 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  41.95 
 
 		 526 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  47.6 
 
 		 551 aa  413  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  44.05 
 
 		 573 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  44.97 
 
 		 520 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  44.97 
 
 		 520 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  48.68 
 
 		 525 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  46.61 
 
 		 533 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  41.87 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  47.42 
 
 		 497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  43.64 
 
 		 531 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  44.37 
 
 		 657 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  46.25 
 
 		 545 aa  398  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  45.54 
 
 		 550 aa  393  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  41.07 
 
 		 573 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  40.83 
 
 		 530 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  43.6 
 
 		 606 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  41.27 
 
 		 583 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  43.76 
 
 		 583 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  45.18 
 
 		 542 aa  389  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  43.61 
 
 		 530 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1122  transporter, BCCT family protein  48.6 
 
 		 515 aa  386  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  40.55 
 
 		 574 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  42.02 
 
 		 661 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  42.24 
 
 		 637 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  43.63 
 
 		 656 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  43.51 
 
 		 661 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  41.05 
 
 		 580 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  46 
 
 		 660 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  40.59 
 
 		 585 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  40.76 
 
 		 667 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  42.6 
 
 		 682 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  41.58 
 
 		 567 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  45.05 
 
 		 524 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5374  choline/carnitine/betaine transporter family protein  42.44 
 
 		 567 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985383  normal  0.22306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  41.35 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  42.8 
 
 		 682 aa  382  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  41.54 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  44.23 
 
 		 525 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  43.37 
 
 		 661 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  41.14 
 
 		 582 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  42.25 
 
 		 538 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  41.67 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  41.14 
 
 		 582 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  42.12 
 
 		 581 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  41.18 
 
 		 582 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  42.97 
 
 		 514 aa  376  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  41.9 
 
 		 582 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  40.36 
 
 		 581 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  41.45 
 
 		 538 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  45.26 
 
 		 637 aa  379  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  41.88 
 
 		 580 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  43.38 
 
 		 685 aa  378  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  41.28 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  41.51 
 
 		 606 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  42.23 
 
 		 523 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  45.38 
 
 		 658 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  40.94 
 
 		 676 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  45.38 
 
 		 658 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  45 
 
 		 658 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  45.38 
 
 		 658 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  45.58 
 
 		 668 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  44.78 
 
 		 673 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  41.72 
 
 		 540 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>