More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3748 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_5313  BigG family transcription antiterminator  89.33 
 
 		 358 aa  666    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5314  BigG family transcription antiterminator  88.33 
 
 		 550 aa  982    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5052  BigG family transcription antiterminator  88.78 
 
 		 891 aa  1637    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.309517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4882  transcriptional antiterminator  88.78 
 
 		 891 aa  1636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4997  PTS system transcriptional activator  87.78 
 
 		 892 aa  1621    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4897  transcriptional antiterminator  88.66 
 
 		 891 aa  1634    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0871125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5369  transcription antiterminator, BglG family  88.66 
 
 		 891 aa  1634    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000331131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5635  transcription antiterminator, BglG family  88.22 
 
 		 891 aa  1623    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396867  hitchhiker  0.00000000250243 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5293  transcription antiterminator, BglG family  88.78 
 
 		 891 aa  1637    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5437  BigG family transcription antiterminator  88.78 
 
 		 891 aa  1637    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.250784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  47.56 
 
 		 892 aa  815    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  39.64 
 
 		 901 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5324  transcription antiterminator, BglG family  88.44 
 
 		 891 aa  1627    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3748  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  100 
 
 		 897 aa  1864    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00968283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  38.66 
 
 		 977 aa  503  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4597  sigma-54 factor, interaction domain-containing protein  31.26 
 
 		 906 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.956591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0131  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  29.76 
 
 		 915 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4788  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.53 
 
 		 921 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.566133  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4889  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.31 
 
 		 921 aa  310  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2191  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  44.58 
 
 		 437 aa  309  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4948  sigma-54 interaction domain-containing protein  29.28 
 
 		 921 aa  307  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.725422  normal  0.337098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3278  sigma-54 dependent transcription regulator  27.06 
 
 		 932 aa  303  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0683  AAA superfamily ATPase with N- receiver domain  27.38 
 
 		 880 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3998  sigma-54 dependent transcription regulator  27.99 
 
 		 932 aa  300  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4103  sigma-54 dependent transcription regulator  28 
 
 		 932 aa  300  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4052  sigma-54 dependent transcription regulator  28 
 
 		 932 aa  299  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0716366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3980  sigma-54 dependent transcription regulator  28.28 
 
 		 932 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0624  AAA superfamily ATPase with N- receiver domain  27.26 
 
 		 909 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3954  PTS system transcriptional activator  43.22 
 
 		 869 aa  240  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0961  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 454 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2114  Fis family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 573 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3833  putative sigma54 specific transcriptional regulator  35.42 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.859471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0508  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  34.47 
 
 		 495 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0219  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.38 
 
 		 605 aa  112  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.355755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3117  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.1 
 
 		 555 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.45 
 
 		 459 aa  111  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1337  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.93 
 
 		 679 aa  112  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0476  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.68 
 
 		 451 aa  111  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4003  putative sigma54 specific transcriptional regulator  36.68 
 
 		 451 aa  111  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0963  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  32.18 
 
 		 467 aa  110  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3798  helix-turn-helix, Fis-type  35.61 
 
 		 558 aa  110  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.852136  hitchhiker  0.00299193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2741  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  30.82 
 
 		 471 aa  110  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1901  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 473 aa  110  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2922  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.09 
 
 		 491 aa  110  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0674  two-component response regulator CbrB  33.33 
 
 		 453 aa  110  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0916838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1750  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.09 
 
 		 466 aa  109  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0041  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 445 aa  110  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2117  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  35.16 
 
 		 459 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2144  arginine utilization regulatory protein RocR  34.65 
 
 		 461 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.757971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2082  arginine utilization regulatory protein  34.65 
 
 		 461 aa  109  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3620  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.82 
 
 		 449 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351229  hitchhiker  0.00000838354 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2299  arginine utilization regulatory protein RocR  34.65 
 
 		 461 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1407  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.33 
 
 		 456 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2324  arginine utilization regulatory protein RocR  34.65 
 
 		 459 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2333  arginine utilization regulatory protein RocR  34.65 
 
 		 461 aa  109  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2280  arginine utilization regulatory protein RocR  34.65 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2407  arginine utilization regulatory protein RocR  34.65 
 
 		 459 aa  109  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.830853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2078  arginine utilization regulatory protein  34.65 
 
 		 461 aa  109  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1698  helix-turn-helix, Fis-type  37.86 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 454 aa  109  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0702  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 460 aa  109  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1058  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 462 aa  109  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0191246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  34.7 
 
 		 472 aa  109  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1788  sigma-54 factor, interaction region  38.35 
 
 		 542 aa  109  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.337598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3043  arginine utilization regulatory protein RocR  34.65 
 
 		 477 aa  109  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.585344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30810  sigma54-dependent activator protein  35.12 
 
 		 564 aa  108  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0352  putative sigma54 specific transcriptional regulator  33.48 
 
 		 554 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0365  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.48 
 
 		 554 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4419  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 448 aa  108  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3104  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 448 aa  108  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 464 aa  108  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0359  sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  34.98 
 
 		 458 aa  108  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1017  helix-turn-helix, Fis-type  34.76 
 
 		 679 aa  108  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2020  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.18 
 
 		 466 aa  108  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1940  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.61 
 
 		 455 aa  107  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2286  phenol-degradation regulator  38.39 
 
 		 550 aa  107  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0200  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.02 
 
 		 449 aa  107  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0335  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.25 
 
 		 445 aa  107  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2087  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  30.49 
 
 		 451 aa  107  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1152  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.35 
 
 		 488 aa  107  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0888361  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0557  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.97 
 
 		 617 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0596  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.38 
 
 		 617 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1687  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.1 
 
 		 461 aa  107  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113647  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4752  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 477 aa  107  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.102519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3376  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 466 aa  107  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0659  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.19 
 
 		 458 aa  107  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1010  NifA subfamily transcriptional regulator  35.55 
 
 		 510 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3839  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.85 
 
 		 546 aa  107  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.719613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2585  helix-turn-helix, Fis-type  33.73 
 
 		 468 aa  106  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.023304  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2099  Fis family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 574 aa  106  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2148  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 503 aa  106  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2412  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.8 
 
 		 484 aa  106  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2554  type 4 fimbriae expression regulatory protein PilR  32.29 
 
 		 452 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0338  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.23 
 
 		 552 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1428  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 460 aa  106  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2966  transcriptional regulator NifA  35.61 
 
 		 515 aa  106  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3062  two-component response regulator CbrB  34.43 
 
 		 463 aa  106  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03284  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator, Fis family protein  34.39 
 
 		 453 aa  106  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0306  putative sigma54 specific transcriptional regulator  31.4 
 
 		 455 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0365  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.05 
 
 		 464 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>