More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3666 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  396  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  92.27 
 
 		 194 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  87.63 
 
 		 194 aa  351  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  87.11 
 
 		 194 aa  347  9e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 242 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 290 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  24.66 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  20.97 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 241 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 241 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 226 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3554  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.725934  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  21.7 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 376 aa  48.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 230 aa  47.8  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 310 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  25.45 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3782  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.608196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  18.55 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  25.89 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>