132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3558 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  73.33 
 
 
210 aa  334  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  73.33 
 
 
210 aa  333  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  72.86 
 
 
210 aa  331  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  72.86 
 
 
210 aa  331  5e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  71.9 
 
 
210 aa  329  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  71.9 
 
 
210 aa  329  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  71.9 
 
 
210 aa  329  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  72.86 
 
 
210 aa  330  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  71.9 
 
 
210 aa  329  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  72.38 
 
 
210 aa  329  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  33.49 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  32.85 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  31.46 
 
 
219 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  31.46 
 
 
219 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  33 
 
 
212 aa  131  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  33 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  29.72 
 
 
215 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  33.49 
 
 
217 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  32.58 
 
 
228 aa  125  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  32.65 
 
 
209 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00716  hypothetical protein  29.21 
 
 
204 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0795  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 
234 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0423  transcriptional regulator  27.78 
 
 
227 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956901  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1246  putative transcriptional regulator  29.8 
 
 
203 aa  101  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 
210 aa  101  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3358  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 
220 aa  101  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338727  normal  0.270871 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  28.57 
 
 
215 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4997  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 
222 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
235 aa  99.4  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4801  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472031 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  28.22 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  28.64 
 
 
240 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  27.59 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 
253 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5538  putative transcriptional regulator  25.59 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.912326  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1048  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 
207 aa  96.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  30.85 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 
207 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1166  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  27.86 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  27.86 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0435  putative transcriptional regulator  26.94 
 
 
199 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  27.86 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0995  hypothetical protein  30.88 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1018  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 
210 aa  91.7  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 
207 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  29.86 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  27.09 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1043  hypothetical protein  23.65 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0030  hypothetical protein  23.65 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  23.65 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1579  hypothetical protein  23.65 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1494  hypothetical protein  23.65 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  23.65 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  26.96 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  26.37 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0018  putative transcriptional regulator  24.39 
 
 
214 aa  89.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4136  hypothetical protein  24.39 
 
 
214 aa  89  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3788  hypothetical protein  24.39 
 
 
222 aa  89  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4804  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 
210 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000646734 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0077  transcriptional regulator  23.76 
 
 
246 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.53122  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1289  hypothetical protein  23.27 
 
 
253 aa  88.6  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 
280 aa  88.2  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  28.14 
 
 
225 aa  88.2  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0896  putative transcriptional regulator  25.89 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610602 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2284  transcriptional regulator  25.37 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13330  predicted transcriptional regulator  28.8 
 
 
238 aa  85.1  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763143  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  25.87 
 
 
208 aa  84.7  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0888  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 
211 aa  84.7  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1452  putative transcriptional regulator  23.38 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293298  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0402  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1139  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.140272  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  27.57 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  25 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14610  predicted transcriptional regulator  25.65 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1973  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  24.14 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  30.29 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11480  predicted transcriptional regulator  25.7 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1356  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 
248 aa  78.2  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2471  transcriptional regulator  24.76 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2681  putative transcriptional regulator  26.9 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381379  normal  0.0939386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5988  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2441  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.125946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2435  transcriptional regulator  24.76 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2480  transcriptional regulator  24.76 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0307  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.519243  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  23.15 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2102  transcriptional regulator  23.61 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.697253  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2084  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 
291 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1659  putative transcriptional regulator  25.85 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.773243  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5155  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16120  transcriptional regulator  26.19 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>